一般会需要彩超以及生殖激素水平检测。常规检查是通过直观测量阴茎的大小，了解患者是否是小阴茎。在检查的过程中要注意阴茎勃起的长度和硬度，还有了解阴茎海绵体的发育情况等。
阴茎大小和个人体质遗传有关系，正常成人的阴茎在疲软状态下有7-9厘米，勃起以后大概就是11-16厘米。如果疲软状态下小于5厘米，而且勃起时小于10厘米，才能叫阴茎短小。作为大多数男性来讲，性成熟期是18周岁，基本发育就差不多了。
假阴茎短小症：指阴茎在非勃起状态下，固然长度小于3cm，但在勃起状态下却能明显地延长、增粗2~3倍，且不影响性生活。潜伏阴茎：指阴茎虽貌似短小，但用手向后推压阴茎旁皮肤时，可露出正常大小的阴茎。
阴茎短小早泄可以通过手术治疗。阴茎勃起的长度大于三厘米，就属于正常的范围之内。大部分的人都属于正常的，早泄服用一些中药，也可以用一些降低龟头敏感度的药物，饮食上可以吃一些补肾的食物。
阴茎短小的治疗方法包括生理性阴茎短小，多见于耻骨联合部、会阴部脂肪较多的男性，可通过手术治疗，去除多余的脂肪，使阴茎得以延长至正常长度，病理性阴茎短小，染色体异常、克氏综合征、卡尔曼综合征导致的阴茎短小，应及时就诊，明确病因，对症治疗。