龟头炎多采用药物治疗，包括口服和外用抗菌药，如果病人合并包皮过长或包茎可以切除包皮。此外，病人应养成良好的卫生习惯，及时清洗包皮。如果是因为不洁性行为造成的龟头炎，应杜绝。
霉菌性包皮龟头炎的治疗可以保持局部干爽透气。每天使用凉开水清洗，清洗吹干涂软膏类的药物，早晚各一次。如果有脚癣要同时进行治疗。性伴侣也要进行检查治疗。念珠菌属于真菌类，容易在人的浅表部位形成感染，如口腔、阴道、龟头等。男性的龟头、包皮部位感染后称之为霉菌（真菌）性包皮龟头炎。
手术治疗大约需要1个月，非手术治疗半个月左右到20天左右，主要的原因是包皮过长和包茎，诱因主要是最近病人可能生活工作压力大，过度的劳累、进食刺激性食物和饮酒、吸烟过多导致的免疫力低下，也可以通过性接触而诱发。
龟头炎如果不是很严重，一般就是有一些红点或者红斑，或者包皮垢比较多，本身没有太明显的症状，可以先用清水注意清洗，不用专门用药，自己就可以好转，但是一般有大片的红斑，或者瘙痒症状，可以先外用抗真菌的抗生素外用。
龟头炎治疗和预防注意局部卫生，每日清洗龟头和包皮，如包皮过长要及时治疗，必要时作包皮环切术，及时清洁包皮垢很有必要。避免细菌感染，及时治疗，如患有滴虫性或白色念珠菌容易导致包皮龟头炎，影响男性健康。对于急性包皮龟头炎要避免使用药类，以免引起更加严重的感染。
