自身发育问题，内分泌问题，包皮包茎影响，脂肪组织或者腹腔包埋比较多，这些都是导致阴茎短小的原因。最好是到医院后让我们的专家给患者仔细看后，根据患者的具体情况为患者制定最适合患者的治疗方案。
遗传因素阴茎与身体其他器官一样,其大小及形态特点要受遗传基因的控制与影响。发育与营养状况一般来说,成年男性体格健壮,身材高大,其外生殖器包括阴茎、阴囊的发育也较好,阴茎可能较为粗大;反之,则可能相对小一些.但必须提醒的是,阴茎的大小并不与身高成正比例。肥胖男性肥胖是造成阴经短小的又一因素,一些耻骨联合部、会阴部脂肪丰满突出的男性,往往阴经发育欠佳,比起正常男性的阴茎会相对短小。其他患有睾丸炎、隐睾症、睾丸发育不全等症及内分泌不平衡,雄性激素不足,都可能造成阴茎短小。
一般情况下，阴茎短小最明显的症状就是阴茎大小没有达到正常范围。建议及时就医，查明病因，对症治疗。具体情况分析如下：
阴茎短小是指在软弱状态下阴茎小于4厘米或在勃起时小于8厘米。阴茎短小属于外生殖器发育不良，主要是由于睾丸组织功能不好，分泌雄激素水平低，导致外生殖器发育迟缓。如果阴茎勃起不超过5厘米，建议做阴茎延长手术。
引起阴茎短小的原因主要是阴茎先天性的发育不良，包括包茎，隐匿性阴茎。也有可能是由于海绵体的病变导致海绵体萎缩，海绵体硬化，出现阴茎短小。多见于阴茎外伤，或者是高血压糖尿病。
一般情况下，引起阴茎短小的原因主要是先天性的发育不良，包括包茎、隐匿性阴茎。也有可能是由于海绵体的病变导致海绵体萎缩，海绵体硬化，出现阴茎短小。这种情况多见于阴茎外伤，或者是高血压糖尿病的患者。如果是隐匿性阴茎和包颈，可以通过做手术治疗使阴茎增大增长的。如果存在海绵体萎缩的情况，通过阴茎血流多普勒的检查可以明确诊断，然后口服11酸睾酮胶囊，红景天胶囊促进海绵体的生长，可以使阴茎增大。
先天性阴茎短小目前仍无治疗方法。后天性的阴茎短小，主要因睾丸痿缩引起。如长其从事超声、微波、放射线、高温等作业的男性，青春期前腮脉炎合并睾丸炎。长期食用粗制棉籽油等，均可引起睾丸痿缩。