乙肝病毒携带者是很难转阴的。当然，在少数的特定人群里面，有可能实现自发性的转阴，也有可能在干扰素抗病毒治疗后，有少部分的人群能够实现转阴，但这些转阴都是可遇而不可求的。
乙型肝炎目前没有彻底根治的治疗药物上市，但是通过研究调查发现在一些特殊选择的人群中，比如在表面抗原水平非常低，乙肝病毒DNA水平非常低的情况下，而且有一次明显的炎症发作，转氨酶水平大于200以上，这些人经过长期的干扰素治疗，会有30％左右的人会出现表面抗原转阴，甚至出现表面抗体，称为功能性治愈。
应及时进行抗病毒治疗，常见的抗病毒药物可抑制乙肝病毒复制，但停药就复发，需长期使用。长期使用可因产生耐药而失效，故又不宜应用过长，使用半年后应联合用药以避免失效。
妊娠期乙肝一般不需要特殊治疗。
孕妇如果没有肝功能异常，需要定期监测肝功能和肝脏彩超。如果出现合并肝炎，可以通过药物保肝，监测胎儿的宫内情况，必要时及时终止妊娠。妊娠期乙肝孕妇在娩出胎儿后要注射乙肝疫苗和乙肝免疫球蛋白，通过以上阻断，产妇病毒定量不高时，就能正常母乳喂养。
孕期出现不适，建议及时前往医院就诊。
乙肝的治疗应该根据不同临床类型及组织学损害区别对待。治疗的原则均是以足够的休息、合理饮食，辅以适当药物，避免饮酒、过劳和损害肝脏的药物。适当的休息：症状明显或者是病情比较重的应该强调卧床休息，卧床可以增加肝脏的血流量，有助于恢复。