当有病毒变异时，就会有病毒学突破，病毒复制，如果此时肝功正常，无肝硬化迹象，可以不治疗，定期检查。如果肝功异常，肝炎活动期时，是需要治疗的，包括保肝及抗病毒治疗，主要是通过口服保肝药物和抗病毒药物进行治疗。
乙肝小三阳是否需要治疗，患者需根据具体的情况来判断。
对于乙肝小三阳，只要肝脏和dna都没有问题，患者通常为健康携带者，只要按时随访，不用吃药，如果是HBV、DNA、肝脏等指标都比较高，就要进行相应的检查。肝功能转氨酶超过2倍，同时乙肝DNA超过10，则要进行抗菌和护肝治疗，同时还要定期进行肝功能检查和DNA检测。
乙肝小三阳的转阴主要指的是乙肝病毒定量的转阴。乙肝小三阳病情的进展，发生肝硬化、肝癌的危险因素，主要来自于乙肝病毒的复制。所以乙肝小三阳的转阴，首先应该将病毒定量转为阴性，可以选择口服药物，可以在短期内将病毒转阴，肝功能恢复到正常。
可以做肝功能和肝B超检查，如果都正常，则不用治疗，定期每半年做肝功能和肝B超检查就可以了，如果肝功能不正常，特别是转氨酶高，就需要治疗。小三阳只要定期检查，肝功能正常，病毒无复制就没问题。
小三阳在肝功能正常的情况下，一般不需要治疗。但是在乙肝病毒DNA高于2000，谷丙转氨酶超过正常值上限，或者转氨酶虽然正常，但有肝硬化的情况下。对于年龄超过30岁，病毒量很高，虽然没有肝硬化，但家族中有肝硬化和肝癌的，也可以考虑治疗。