肝动脉栓塞术副作用就是引起免疫功能改变，体质也会下降，甚至蛋白质产生能力都会受到影响，有一部分肝脏就没有功能了。肝脏有动脉发生的病变或者是进行肝动脉栓塞术，主要是介入的方式治疗肝癌比较常见或者是动脉有问题，所以必须阻断。
动脉栓塞指栓子顺着血流方向流向远端，停留在与之口径相等的血管引起阻塞，导致此动脉供血脏器组织缺血、缺氧，甚至坏死的一系列临床表现。最常见于风湿性心脏病、心房纤颤、心肌梗死等疾病形成的心脏附壁血栓，随心脏跳动而脱落。其次还可见于脂肪、异物、空气等栓塞。
眼底视网膜动脉阻塞，缺血性视神经病变等动脉阻塞性眼病，都会造成视力严重下降，可以中医眼科辨证论治，中药加针灸治疗。中医认为是，肝阳上越、肝肾亏损、气滞血淤而目系失养。
通常情况下，肾动脉栓塞的治疗关键在于恢复肾脏血流。具体情况分析如下：
临床上，治疗肾动脉栓塞的关键在于尽早恢复肾血流量，而抗凝治疗和溶栓治疗是治疗肾动脉栓塞的关键。抗凝治疗主要有静脉输入肝素、口服华法林，溶栓治疗主要有全身性溶栓和肾动脉内溶栓，全身溶栓出血风险相对较高。肾缺血耐受时间一般在60-90分钟左右，因此血管再通越早，肾功能恢复越好。如果肾动脉栓塞严重，导致肾缺血、衰竭、坏死，甚至需要手术切除病变肾脏。
动脉栓塞相对比较严重的，而且治疗起来也比较费劲的尽量尽早的进行治疗，因为这种疾病发病也是比较急的，是容易造成器官坏死的。治疗的费用不见得有很高，治疗以及相对要差一些。