牙齿矫正的过程中有各种副作用，对口腔卫生不好，牙齿上面粘的托槽周围容易引起牙菌斑滞留，时间久了容易引起牙龈炎。需要好好刷牙，控制牙菌斑。金属托槽也容易会导致口腔粘膜的创伤性溃疡，应该注意必要时使用正畸蜡保护。牙齿矫正的过程中，为了使牙齿移动，在牙齿上面施加外力，如果力量过大会引起牙根的内外吸收。
牙齿矫正有可能会改变牙弓，但是由于牙齿畸形的严重程度等情况有一定的关系。如果自身的情况并不是特别的严重，一般不会导致牙弓改变，但是如果比较严重者，很有可能会引起牙弓改变。牙齿畸形可能是由于先天性遗传或者是不良的咬合习惯等多种因素所引起的，通常会导致自己的形象受到影响，而且还会诱发口腔疾病，因此可以使用牙套进行矫正，比如隐形牙套或钢丝牙套。平时也要注意口腔的卫生以及保持合理的饮食，不要吃一些坚硬的食物。
牙齿矫正没有什么危害，只是有部分并发症，初期或导致不适。牙根会变短，因为正畸时在牙齿移动的过程中，有些破骨细胞要把牙槽骨杀伤，可能在杀伤牙槽骨时，并不知道杀伤的是牙槽骨或者是牙根。如果矫治力量大或者患者是易感体质，可能有些患者在矫正后牙根会变短，牙齿可能就不是特别牢固；在矫正过程中，很多患者，本身的卫生习惯不太好，刷牙时间太短、不认真，在牙齿上残留很多的食物残渣。当食物残渣发酵后，产酸，对牙齿产生龋坏作用，特别在牙齿表面，很多时候矫正结束以后发现牙体表面已经变黄，有的还变坑。患有牙周炎、根尖炎的患者需先进行治疗，再进行矫正。同时如禁止吸烟、过量饮酒等。女性应尽量避开月经期、哺乳期、妊娠期。治疗期间应清淡饮食，避免进食辛辣刺激、糖类、油腻及海鲜等腥发性食物。要保持积极的心态，正确地对待治疗。并且做好口腔清洁，注意口腔卫生，做牙齿矫正前最好进行一次洗牙。
在治疗的过程中，因为牙齿会受力，所以有些牙齿会受到影响，影响牙根吸收。成年的女性患者当中可能会出现牙龈萎缩导致的黑三角，甚至极个别的患者会引起关节酸痛，或者肌肉退化。因为在矫治的过程中，医生常会建议不吃硬的东西，或者是有的患者根本就是害怕吃硬的东西会损坏矫治器，所以干脆就改变了自己的饮食习惯，这时对患者的面型会有小小的改变。建议：在做矫正的时候需要医生进行详细的评估，才能决定是否适合做矫正。
牙齿矫正一般不会有危害。矫正牙齿可以让牙齿排列整齐，变得更加美观。目前矫正牙齿最常用的方法就是佩戴牙套，有金属的牙套和隐形的牙套，可以选择适合自己的。矫正期间保持口腔内的清洁卫生，矫正后还需要佩戴保持器维护矫正后的效果，不可以吃过于坚硬的食物。
牙齿矫正多数不会导致人中变短，可以改善牙齿出现的畸形现象。牙齿矫正可以选择佩戴钢丝牙套的方法治疗，是通过钢丝的拉力作用，能够使牙齿排列整齐，改善牙齿出现的前突或者是牙齿有缝隙症状。如果出现人中变短的现象，还需要通过微创手术的方法治疗，能够增加面部的五官协调能力，提高自身的美观。日常要避免吃一些坚硬的食物，以免导致牙齿受到损伤，还要养成良好的刷牙习惯，刷牙的时候使用含氟牙膏。
