于根管预备有时会超出根尖孔，造成根尖组织水肿，组织液外渗会引起术后肿胀疼痛，可以观察几天，肿胀疼感会慢慢消失。根管治疗完成后仍有疼痛感时，可拍摄口腔x片，观察是否有遗漏的根管，如果有遗漏的根管，应及时对遗漏根管进行再一次的根管治疗。根管治疗术后几年后然后疼痛，应及时观察根管治疗是否彻底，必要时行二次根管治疗术。
根管治疗牙疼，如果仅仅发生在根管治疗刚刚结束，牙齿出现胀痛或者叩痛，都是非常正常的术后反应，一般1-2周左右会完全的消失，是因为根尖有炎症所导致的。如果在根管治疗后1-2年左右出现牙疼的情况，很有可能是根管治疗时牙神经没有完全取净，或者根管充填时并没有充填严密，导致细菌有残留，重新诱发了根尖周炎，需要重新进行根管治疗。
根管治疗根据根管数目不同，需要700-2000元左右。牙疼根管治疗是根据患牙根管数目来决定费用。如果是单根管，治疗下来的总费用大约700-800块钱，例如上颌前牙、下颌前牙以及尖牙等。如果所治疗的患牙有两个根管，治疗的费用大约在1200-1300块钱左右，例如上颌双尖牙、下颌双尖牙。如果所治疗的患牙有3个根管，例如上颌第二磨牙以及下颌第二磨牙，治疗的费用大约在1500-1600块钱左右。如果所治疗的患牙有4个根管，治疗的总费用也是最高的，一般治疗完以后，费用大约在2000块钱左右。
根管治疗后，由于牙髓腔和根管内充填了实性的根管治疗专用材料牙胶，所以会有轻微的胀痛感，多为3-5天，症状即会逐渐减轻，直至消失。若是根管治疗后牙齿持续疼痛，没有逐渐好转的表现，就是治疗出现了问题。
术后疼痛反应正常，这是因为在根管治疗中，牙齿或多或少受到磨损，牙齿有敏感的刺激，所以疼痛，般会在几天后消失，对根管充填材料过敏，因为在根管治疗前，没有发现有一些会有过敏反应，使用了一些不适合的填充材料，在治疗后牙齿会伴有疼痛。
牙疼根管治疗是把坏死的牙髓组织或特殊情况下没有坏死的牙髓组织去除掉，然后再将根管进行扩大冲血，把感染完全去除后在进行根管充填的过程。根管治疗有一定的效果能持续一定时间，效果能够比较永久。