临床所见口腔溃疡大多为复发性口腔溃疡，因为局部疼痛，影响饮食、语言等会给生活带来很大的困扰，所以有口腔溃疡后应该及时治疗，减轻症状。其治疗原则是消除致病诱因，增进机体健康，减轻局部症状，促进溃疡愈合，但是目前还没有特效药物，所以治疗时应针对每个病例的致病诱因和对药物的反应，有侧重地采用治疗方法和药物。
尽量做到规律作息、保证睡眠、适当的进行体育锻炼、保持口腔清洁、饮食全面适度，多吃富含维生素和微量元素的食物，比如水果、蔬菜。同时做到不吸烟，不熬夜，去除口腔内的局部刺激因素，比如残冠、残根、不良修复体等，消除心理压力，减少和控制不良的情绪，减少口腔溃疡的复发率。
口腔溃疡可以饮食清淡易消化一些多喝水，口服一段时间维生素改善症状。口腔溃疡是口腔科常见的黏膜性疾病，可反复发作。口腔溃疡与自身免疫状况、周围环境、水土情况及自身遗传因素有关。
出现口腔溃疡需要补充维生素。口腔溃疡可能是精神因素导致的口腔溃疡、病毒感染造成的口腔溃疡需要是抗病毒治疗，创伤造成的口腔溃疡，烫伤造成的口腔溃疡，有针对性的进行补充。
冰硼散、青黛散、养阴生肌散、黄连散等，是中药外用治疗口腔溃疡的主要散剂，主要将药物直接喷洒或者是涂抹于患处，就可以起到止痛、敛疮、生肌的作用，可以说是使用简单携带方便而且标本兼治，最适合现在工作忙碌的上班族了，而其中应用最为广泛、疗效最受肯定的应当属于冰硼散。
口腔溃疡的治疗主要是促进愈合，减少复发。促进愈合的治疗，主要有两个方面，一是预防感染，可以含漱抗感染的漱口水。二是促进黏膜修复，局部应用生长因子喷雾剂贝复剂，副作用较小效果好。特别是深大溃疡，长期不愈合的效果肯定；促进黏膜修复也可以局部应用激素，激素副作用较大，不能长期使用。减少复发，主要是西药调理免疫功能，中医中药辩证调理。局部减少创伤，防止形成溃疡。