宝宝半夜发烧39度应该及时遵医嘱使用口服布洛芬混悬液来治疗，要遵医嘱。
布洛芬混悬液的退热效果很好，一般在半小时之内会出现明显退热，但退热时间维持不稳定，大约4到6小时，但是该药用药间隔至少4到6小时，24小时运用最多不能超过四次，并且使用该退热药物的时候，一定及时给宝宝补水，避免造成脱水，另外要遵医嘱使用。
宝宝长牙发热一般不会超过39℃，具体情况分析如下：
宝宝长牙出现发烧的原因是因为牙龈痒、孩子乱吃东西、乱咬东西等。不过体温通常不会高于38.5℃，如果是由于牙齿的健康和身体的免疫调整能力的调整，可以自动退热，所以发热不会很严重。体温高达39℃，要考虑有没有其它的炎症或者发热的原因，要及时服用退热的药物进行退烧。
孩子出现发热，体温39℃，需要立即口服退烧药物治疗，在口服退热药物以后，应该注意少量多次饮水，配合物理降温退热。物理降温就是用温水连续的擦拭颈部、额头、腋下等部位辅助退热。
孩子发烧39度属于高烧，需要及时降温，可以用口服退烧药物等方法降温，高烧一般是病毒性感染，常见的病毒有流感病毒，鼻病毒，腺病毒，可以用抗病毒的药物治疗，咳嗽可以喝糖浆。也可能是细菌性感染，常见的细菌有金黄色葡萄球菌，溶血性链球菌。
如果没有退烧药可以采取物理降温疗法使体温恢复正常，如用湿毛巾湿敷额头，颈前腋下，腹股沟等处，也可以外用退热贴治疗。发热多是感染性的，可由于细菌，病毒等感染引起。