一般情况下，对出生缺陷进行产前诊断是十分有意义的。先天性疾病是先天性疾病，早期没有任何的征兆，如果没有及时的处理，错过了最好的治疗时间，所以治疗的结果并不是非常的好。而对新生儿进行早期的检查，可以使儿童早期发现、早期确诊、早期处理，从而提高新生儿的身体素质，减少婴儿和婴儿的死亡，提高儿童的预后。而检查的费用，也不算太高，只需要数百块。主要以心听诊法、经皮静脉血液氧饱和度测定两项方法进行筛查，既节省时间，又不会对胎儿造成损害。
单纯的先天性心脏病，比如房间隔缺损、室间隔缺损、动脉导管未闭这三个最常见的先天性心脏病，大部分可以通过手术或者是介入手术来达到治愈的目的。一些复杂性先天性心脏病，是可以部分纠正，有一部分也可以达到治愈的目的。
新生儿先天性心脏病筛查的方法，主要通过医生的临床查体和心脏的超声检查来进行，医生通过心脏的叩诊和心脏各瓣膜区的听诊，来判断新生儿是否有心脏的异常，如果发现有病理性的杂音，再进一步进行心脏超声的检查。
治疗先天性心脏病有三种主要方法：药物治疗，手术和介入治疗。但是，治疗方法的选择取决于孩子的状况。心脏病医生会根据孩子的情况给出。治疗建议。如果孩子是非分裂或从左到右的分流，两种情况的预后都非常好。如果心脏从右向左转移，则是一种严重的疾病。这种手术非常困难。由于心脏结构的不完全发育，一些病者无法完全矫正。生活质量。
先天性心脏病的类型较多，结构异常超过数百种。预期寿命与先天性心脏病的类型、是否及时治疗有关，存在一定个体差异。简单先心病病人若及时治疗，转归相对较好，甚至通过等待可以达到自行闭合，与正常人无明显差异，对预期寿命无任何影响。大量左向右分流型先心病病人，由于各方面因素未及时治疗，成人期合并肺动脉高压，则错过了手术时机，最终会因为心衰、缺氧等情况而导致死亡。
有一些先天性心脏病跟遗传有关系，比如有一些综合征，比如马凡氏综合征或者21三体综合征，往往会合并有先天性心脏病，这是基因和染色体的遗传问题导致的，所以与遗传也有关系。