治疗上要注意及时的对症治疗，同时还需要应用生长激素来促进骨骼的生长。颅脑畸形导致的颅内压增高，需要进行减压分流；椎管狭窄的患者可以选择椎板切除和减压。另外，儿童由于四肢活动不方便，活动减少，从而引起肥胖。可以戴上脊柱支架，避免脊柱的变形。儿童在成人后能适应各种不同的工作，只要患儿能够正常生存下去，其预后也会更好。
一般情况下，一般软骨发育不全的治疗大多是通过滋养软骨，使其得到修复。
对于软骨发育不全的患者，在用药方面除了外敷活血化瘀膏药外，可以适当口服一些消炎药，例如扶他林，并配合一些滋养软骨的保养药物，如硫酸氨基葡萄糖等。需要注意的是，患者平时要尽量卧床休息，不要从事重体力活，养成良好的作息规律，有利于身体康复。
宝宝发育挺好，核磁显示髓鞘发育不全考虑是因为发育迟缓导致的，那么注意给宝宝进行补充各种营养，比如优质高蛋白，微量元素，各种维生素，而且要注意多进行沟通交流，有利于促进宝宝生长发育。并且要注意做一些恢复性的训练，慢慢可以恢复正常，不要担心。
卵巢发育不全就会对卵子的产生具有一定的影响，严重的话还会导致女性出现不孕不育的现象。可以通过促排卵药物的方法来进行治疗，在治疗卵巢发育不良的时候，要是选择正规的医疗机构来进行治疗。
喉软骨发育不全需要给予足量的钙及维生素D，特别注意防治呼吸道感染及咽喉炎症，吸气时发生喉鸣，到两岁左右就好了，大多数的在生后无症状，多在生后七到十四天症状显露。
调整饮食忌辛辣油腻的食物，以低热量高蛋白质的食物动物的肝脏、瘦肉、排骨、蛋类、奶制品、牛羊肉等食物为主然后把瘦肉、动物的肝脏切成肉末熬粥服用（怀山药，白扁豆，茯苓，大枣，山楂，胡萝卜片功效：健脾开胃，适合于食欲不振，抵抗力较差的人），增加食欲。必要的时候直接使用口服液促进钙的吸收。