大拇指的指甲出现这种改变，多和甲床功能异常有关，也有真菌感染的可能，缺铁缺钙所致的指甲异常，多会包括所有的指甲的，可以到皮肤科检查看看，如果是真菌感染可以用药物治疗。
一般情况下，大拇指甲盖凹凸不平可能是缺钙、甲癣等因素造成的，具体内容如下：
1.缺钙：如果患者存在营养不足的情况，体内可能会缺钙，可能会对指甲的生长造成一定的影响，可能出现大拇指甲盖凹凸不平的情况。患者可以遵医嘱使用葡萄糖酸钙口服溶液等药物进行治疗。
2.甲癣：真菌感染可能诱发甲癣，可能导致患者大拇指甲盖凹凸不平，还可能变脆、发黄。患者应及时就诊，遵医嘱使用盐酸特比萘芬软膏等进行治疗，以免病情进一步发展。
儿童指甲凹凸不平是营养缺乏，当宝宝存在铁缺乏时会出现反甲，指甲呈勺状，且指甲脆弱，平日有挑食、偏食、肉类食物摄入过少的习惯，如果存在低钙，指甲层竖条纹状，平时户外活动少、体格发育状况差，要及时带宝宝到医院进行微量元素检测。
可能是过性的损伤甲床，从而形成指甲的不平。另外如是缺乏微量元素，缺乏必要的营养物质尤其是蛋白质，严重消耗性的疾病，如严重的肝病、糖尿病等，也可以导致指甲凹凸不平。
大拇指指甲上凹凸不平要考虑最近是不是有一些经常用手的重体力劳动，造成指甲损伤，近期饮食习惯的不良，维生素缺乏，以及熬夜劳累都会导致体内营养缺乏，而造成指甲凹凸不平。
有四种可能，指甲营养不良，甲真菌病，外伤后或者某些皮肤病的甲改变。去医院就诊，先进行全身检查看是否伴有其他部位的皮肤损害，如若没有，进行甲屑真菌检查，排查灰指甲后，考虑甲营养不良可能性大，可以进一步完善微量元素检查，针对性补充微量元素。