阴茎上长小肉芽很有可能是尖锐湿疣导致的，尖锐湿疣属于性病，感染的途径主要是性接触，但有些人没有不洁性接触也有感染的情况，目前还不能确定，要做局部的检查看是假性湿疣还是尖锐湿疣，尖锐湿疣疣体，是HPV病毒在局部的黏膜感染造成的。
阴茎长小肉芽，考虑是尖锐湿疣的，主要是，高危性生活引起的传染性疾病的，如果尖锐湿疣，需要及时治疗，一般通过激光或者冷冻治疗，如果是颗粒，冠状沟部位考虑是珍珠疹。
阴茎肉芽由于尖锐湿疣病毒的感染，导致皮肤粘膜的良性增生。主要是以外治为主，内治为辅。外治的方法很多，有药物治疗，冷冻治疗，激光治疗，微波治疗，电烧治疗，手术治疗等。
阴茎肉芽疼多数考虑是尖锐湿疣引起的，也不排除是一些正常的胬肉增生，要到医院专科检查一下。目前如果没有什么不适，可以暂时不用处理，观察为主。明确诊断以后，再针对性用药治疗。
可能是直接性接触引起的。通过不洁性生活进行传播是阴茎肉芽最主要的传播途径，据研究有2/3与阴茎肉芽患者有性接触的人可患阴茎肉芽。通常通过不洁性生活的人，经受损的皮肤和粘膜感染HPV病毒的可能性会加大。