幼儿发烧39度是比较严重的，可以采取药物治疗或一般治疗。
在医师的建议下，可以选择适当的物理降温和退烧药。物理冷却是指用温水擦额头，后颈，腹股沟，腋窝，手掌，脚心，或是用一块布把冰敷在额头，腋下和腹股沟的主干上。退烧药要在医生的指导下服用，不要因为退烧就吃的多，也不要在服药之间的间隔期过长。平时要多给幼儿多饮一些热的水，促进体内水分的补充，可以帮助幼儿进行排泄，还可以降低体温。
发烧39度要用退烧药物或者物理降温的方法来退烧，可以选用非甾体抗炎药进行退烧，使用冰敷的方法，冰敷在腋窝下和额前，使用酒精擦浴的方法，同样在额部和腋下以及大腿内侧进行退烧。
吃退烧药后还反复发烧，在吃退烧药的同时。用退热贴或者物理降温，多喝温开水，监测体温。物理降温就是用温水毛巾擦洗孩子全身各部位，额头，颈部，前胸，后背，腹股沟，腋窝，四肢等，每次擦洗10分钟以上，监测体温，多喝温开水。正常体温超过38.5度以上，需要吃退烧药，体温在38.5度以下，不用吃退烧药，用退热贴物理降温，多喝温开水监测体温。
婴儿发热达到39度的时候，已经属于高热的范畴，需要使用药物进行退热的，但是注意小于6个月的婴儿尽量不用退热药物，而是以喝水、物理降温、观察为主，在病情确实需要的时候，再吃退烧药。
宝宝高烧39度，身体肯定会发烫的，时候需要及时给孩子吃退烧药治疗。另外可以给孩子洗个温水澡，有助于身体散热，密切观察孩子体征变化，如果出现惊厥抽搐症状，需要让孩子平躺，保持呼吸道通畅，避免分泌物呛到气管。
考虑主要是孩子发烧39度的情况，针对孩子这种发高烧的情况，可以考虑给孩子口服一些退烧的药物进行治疗，会有一定的改善作用的，也可以配合局部外用一些退烧贴，或者是局部用酒精擦拭都是可以的。