怀孕初期胚胎发育不良，可能是由于卵子的质量和精子的质量较差，受精卵形成后由于受到细菌、病毒、药物、辐射等的不利影响，或者是由于遗传、染色体等方面的原因，导致胚胎发育不良。可能是子宫内膜较薄，内膜的营养不丰富，受精卵移植到宫腔后接受不到足够的营养供应，也会出现胚胎发育不良。
胚胎发育不良即胚胎停育，胚胎不按照妊娠时间规律生长、发育，常与精子畸形、孕妇内分泌失调、母体排斥胚胎、子宫内膜太薄、生殖道出现炎症、接触有害的化学物品等有关。胚胎发育不良的孕妇可无明显症状，也可出现下部疼痛、阴道流血，常出现早孕反应如恶心、呕吐等症状逐渐消失。
流产后三个月月经还没来也没怀孕可能是因为内分泌紊乱导致的月经不调引起的。流产以后，子宫内膜较薄，同时体内雌孕激素水平降低，需要重新调整月经周期。可以口服一些雌激素，加强室内膜增生。
胚胎发育不良，主要表现为胚胎发育缓慢和胚胎发育停滞。
胚胎发育迟缓会对胎儿的生长发育和智力发育产生影响，早期B超检查与孕周不符，后期会出现器官发育不全，从而导致早产，流产，胎儿畸形，胎死。
胎儿发育停滞早期一般不会表现出明显的症状，随后可能会出现阴道流血、小腹疼痛等情况。
胎儿在子宫内的发育，如果体重低于正常儿童的十分之一，说明胎儿发育不良。如怀孕高血压等，在早期就被诊断出来。这种疾病会对胎儿的生长造成一定的影响，所以要及时的进行治疗，避免对胎儿造成伤害。
胎儿发育不良的原因有两种，一种是内在的，一种是外在的。
外在因素主要是受到外界的干扰，如电磁、环境等。此外，怀孕期间使用不当的药品，以及药品的刺激性也会导致胎儿的生长。女性体内的激素分泌不足，会造成胎儿缺乏养分，使胎儿不能充分的生长。另外，也可能是因为胎儿本身的染色体问题，从而造成胎儿的生长缺陷。精子和卵子的品质都会对胎儿的发育造成一定的影响，而优质的精子和卵子对胎儿的发育是非常有益的。