肾盂肾炎是由于细菌感染到肾盂部位而引起的。肾盂是肾脏产生的尿液所汇聚的部位，部位如果出现细菌感染，就称之为肾盂肾炎。肾盂肾炎的发生一方面和抵抗力降低有很大关系。
本病致病菌绝大多数为革兰阴性杆菌，以大肠杆菌最常见。主要感染途径是上行性感染，即致病菌由尿道上行入膀胱引起膀胱炎，继而沿输尿管向上蔓延至肾脏，导致肾盂肾炎。肾盂肾炎治疗主要是进行积极抗感染治疗，如果用药物治疗7天没有效果需要复查血常规以及尿常规，如果没有明显好转，需要选择尿培养，选择敏感抗病毒药物进行治疗。
急性肾盂肾炎就是俗称的感染类疾病中间的一种，跟肾小球肾炎不一样。肾小球肾炎，实际上是一种免疫异常在肾脏的发生，而肾盂肾炎大部分原因是因为细菌感染，从尿道上行到肾脏造成感染的发生，导致急性肾盂肾炎的发生。
肾盂肾炎的感染途径包括上行感染、血行感染、淋巴道感染和直接感染。上行感染是病原微生物通过尿道进入膀胱输尿管、肾盂、肾盏导致的感染，是肾盂肾炎最常见的感染途径，致病菌是大肠埃希杆菌。
由于女性的尿道较男性尿道要宽、短、直更容易引起尿路感染，病原菌经尿道口上行至肾盂引起感染。为了避免发生尿路感染，平时要多饮水增加排尿次数，以便对尿道起到冲洗的作用，避免憋尿，每天进行下体的清洗。
诱发急性肾盂肾炎的前驱感染，往往是溶血性链球菌致肾炎菌株所导致的常见的上呼吸道感染，或者是皮肤感染。尤其常见的就是皮肤脓疱疮等链球菌感染之后，引起的急性链球菌肾小球肾炎。除了链球菌感染之外，还可以见到有少量的其细菌，或者是病毒、寄生虫感染，也可以引起急性肾盂肾炎。