小孩子咳嗽和扁桃体肿大是两个疾病，如果咳嗽久治好不了，需要排除鼻窦炎引起的鼻涕倒流到咽喉部，引起的反射性咳嗽可能。而扁桃体单纯性的肥大，是没有关系的。小孩子的咳嗽如果已经排除了下呼吸道的感染，可以到耳鼻咽喉科，遵医嘱进行治疗。
扁桃体肿大就是提示有内热，可以口服清热解毒的药物治疗。然后咳嗽可以给予止咳药缓解。要是有发热的，有高热的，就要进行退热的处理。宝宝的扁桃体肿大引起咳嗽。常见的就是急性扁桃体炎，有些会引起发热，但是咳多数是干咳为主。如果宝宝咳嗽有痰的，那就必须要考虑宝宝是不是合并有支气管炎。
一般情况下，小孩扁桃体肿大，可以通过药物治疗、手术治疗等方法进行治疗。具体分析如下：
1.药物治疗：小孩扁桃体肿大，多见于急性扁桃体炎，伴有发热、轻咳、咽痛等症状，家长可以在医生的指导下使用复方金银花颗粒、阿莫西林胶囊、罗红霉素片等药物给宝宝治疗。
2.手术治疗：小孩扁桃体持续性肿大，即使予以抗感染等对症治疗，依然无效，可以考虑手术切除扁桃体。
家长要让小孩多休息，注意保暖，空气注意流通；平时要让宝宝多喝水，预防脱水，同时加强营养摄入。
小孩子扁桃体肿大，首先应该注意休息，多喝水，通大便，吃一些容易消化的流食、软食。如果咽痛明显时，要注意尽早输液治疗，以免感染扩散，对扁桃体患儿应该少吃刺激性的食物。每次吃饭之后，要记得漱口，注意口腔卫生，多补充体内水分，可以让宝宝多锻炼身体，提高机体免疫力。
临床上把扁桃体肿大分为三度，I度，扁桃体肿大不超过咽腭弓。II度，超过咽腭弓但不达到咽后壁中线。III度，肿大达或超过咽后壁中线。如果扁桃体为Ⅰ、Ⅱ度肿大，没有发热、咽痛等临床症状，可以暂不做处理，继续观察即可。如果由发热咽痛等上呼吸道感染症状，可以应用一些感冒药物。如果扁桃体肿大已经达到Ⅲ度，并且有呼吸道阻塞或者睡眠呼吸暂停症状，还是到耳鼻喉科专科就诊，评定是否需要手术切除。
孩子的情况就是一般的扁桃体肥大，与慢性扁桃体炎有关，如果孩子每年发作几次扁桃体炎，就要考虑手术切除，如果孩子扁桃体炎发病不频繁，可以继续观察，随着孩子发育，大多数可以逐步好转。