子宫腺肌症是子宫内膜异位症的一种特殊情况，也属于子宫内膜异位症，两者的区别主要是：子宫腺肌症的发病部位在子宫上，而一般是子宫内膜异位症的发病部位大多数在卵巢上。宫内膜异位症的主要病理变化为异位内膜周期性出血及其周围组织纤维化，形成异位结节。
子宫腺肌症是子宫内膜异位症的一种。子宫内膜异位症是子宫内膜长到了子宫内膜以外的地方，异位到子宫肌层就叫做子宫腺肌症，异位到卵巢就叫巧克力囊肿，异位到盆腔就叫盆腔子宫内膜异位症。子宫腺肌症疼痛难忍，药物治疗无效时需要手术治疗。
子宫腺肌症一般不是子宫内膜异位症。
子宫腺肌症与子宫内膜异位症同属子宫内膜异位疾病，均为子宫内膜异位生长引起子宫腺肌症，均因子宫内膜腺体入侵子宫肌层的临床表现月经量增多所致。此外还有一部分患者会伴有月经过多或者不规则阴道流血等现象，这些情况统称为经期性障碍，即经期长或持续出血。经期延长呈进行性加重痛经一般在行经前1周开始疼痛，到行经时为止。月经期长，严重影响了患者的生活质量，也给患者带来极大痛苦。
子宫腺肌症和子宫内膜异位症，这是不同的妇科疾病，如果得了子宫内膜异位前进行手术治疗，子宫腺肌症，异位到了子宫肌层内。是良性疾病，但是很难治好的，没有特效药，即使手术，也不能治好。
子宫腺肌症和子宫内膜异位症是不一样的。子宫腺肌症是子宫内膜侵入子宫肌层所引起的。子宫内膜异位症是子宫内膜发生了异位生长。这两种都是属于妇科疑难杂症，有可能会引起痛经。也有部分人会同时存在。
子宫腺肌症和子宫内膜异位症不是同一种病。子宫内膜异位症通常发生于卵巢。临床表现为痛经。经期延长。子宫腺肌病是进行加重的痛经。应去做b超。主要的共同点就是痛经比较厉害，是进行性加重的。而且如果是严重的子宫内膜异位或者子宫腺肌症，都可能会影响怀孕的。