跟肥胖，压力大，休息不好，内分泌紊乱等方面有关，有性激素水平异常，排卵障碍，月经紊乱等症状表现。女性月经期一定要杜绝性生活。要注意自身保暖，避免感寒着凉。月经期间，禁止一切激烈体育运动及重体力劳动。随时调整自己的情绪，保持乐观开朗的心态，使机体免疫系统的功能正常。要去正规医院进行治疗，不要耽误治疗时期。
内分泌紊乱是导致巧克力囊肿的最常见原因，主要高发于内分泌旺盛的生育年龄，尤其是如果长期处于紧张压力或者不安等情绪影响下，都非常容易因为内分泌失调而诱发疾病。还有因为多次分娩或者流产，容易导致子宫内膜粘连，进而引起子宫内膜碎片排出不畅的问题，因此这些废旧垃圾，就容易堆积在宫腔内，而不能经由阴道排出，长期这样，就有可能触发巧克力囊肿。
一般的水果都可以吃的。食物还是应该吃蛋白含量高一些的。平时注意休息，不要过度劳累，不要熬夜，不要吃生冷辛辣的食物。术后应该注意的事项有，平时的卫生习惯一定要注意，不要阴道冲洗。
患巧克力囊肿的原因有痛经，却是最容易忽略的先兆，常进行性加重。性交疼痛，这也是一个明显的信号，可能还伴有点状出血，卵巢巧克力囊肿的症状并不是十分的明显。不孕及月经失调，在不孕的女性中，子宫内膜异位造成的不孕占有很高的比例。
如果已经怀孕了，密切关注孕酮变化及巧囊大小变化；妊娠也是对巧囊的一种治疗和控制。巧克力卵巢囊肿治疗方法主要采用药物和手术治疗。药物治疗包括：假孕疗法，假绝经疗法等，但只能缓解症状控制发展，停药后，即复发，故对卵巢巧克力囊肿多主张手术治疗，手术治疗包括腹腔镜手术和开腹手术，可行囊肿剥离术加卵巢成形术，不需要生育的，行半保守手术，即全子宫切除加患侧附件切除术。
子宫内膜息肉和囊肿可以联合手术。
子宫内膜息肉手术一般是宫腔镜下息肉摘除手术或根治性手术，卵巢囊肿的外科治疗包括腹腔镜下的囊肿剥除术和开腹的患者。术前要进行血常规、凝血功能、肝肾功能、便常规、超声等检查，以确定囊肿、息肉大小、患者的具体情况，确定患者的具体情况，然后再进行手术。手术后要多注意补充营养，多休息。