少数肛周脓肿药物，热水坐浴及局部理疗等可以消散，但多数需要手术治疗。平时应该注意不吃辛辣刺激，注意局部卫生，饮食以清淡易消化为主，禁食辛辣刺。激性油腻食物，适当补充营养。
平时养成良好的卫生习惯，勤洗澡，勤更衣，保持肛周清洁。炎症初起时坚持定时正确的坐浴方法。保证充足睡眠，鼓励病人多饮水，多食易消化、有营养、含纤维多的食物预防便秘。
肛周脓肿应该使用抗生素，一般都是应用，革兰氏阴性杆菌的抗生素，温水坐浴，理疗烤电。手术切脓肿切开引流是治疗的最主要的办法，诊断明确就应该切开。肛周脓肿又叫直肠肛管周围脓肿是指，直肠肛管周围的软组织或间隙发生的化脓性炎症。脓肿是急性期的表现，肛瘘是慢性期的表现。
肛周脓肿是可以发生在肛门，肛管及直肠周围等部位。如果是肛周皮下脓肿，是可以采取切开排脓术来处理，如果伤口恢复的好，大多数恢复天数在十天左右。伤口如果愈合不好或者继发感染恢复的时间就会有延长。如果是高位肛周脓肿，是需要采取挂线术来治疗，手术方法复杂，伤口愈合也比较慢，愈合的好也需要一个月左右才能够恢复。
可以现在行肛瘘切开引流手术，治疗渗液的问题，也可以待瘘管疤痕化形成后形肛瘘再手术。手术是治好的好办法，浅表瘘可以用切开法。较深可以用挂线法。肛周脓肿，无痛，并有脓液由肛门流出，认为是较浅表的肛周脓肿。同时已形成肛瘘。
可以去医院肛肠外科检查一下，如果是痔疮就需要手术治疗的。多吃清淡易消化的食物，禁辛辣刺激性食物和油腻煎炸食物。注意患部卫生，保持患部清洁干燥，勤换内衣内裤，药物针对于痔疮效果较显著，并且是纯草本的，也没有什么副作用的。