如果胎儿脑积水较轻，小于1CM,部分可自然消退吸收。如不完全退行，则可在胎儿出生后经处理及分流手术根除。
如脑积水较重，在一般情况下，对于胎儿智力及发育都有一定影响，因此，提示应及早预防及确诊胎儿。建议孕妈妈多吃一些含蛋白质食物，补充蛋白粉、以及各种营养成分如复合微量元素，提前防止宝宝脑积水。主张孕妇要做好自我防护工作，经常进行胎儿排畸筛查工作，预防弓形虫病毒感染，避免婴儿脑积水。
在怀孕的时候出现有胎儿脑积水的病情，需要根据胎儿的具体检查情况来选择合适的治疗方案，一般引产终止妊娠。病情比较轻微，胎儿侧脑室增宽没有达到15毫米及以上的，根据侧脑室增宽数值及超声检查其他软指标异常，可以选择胎儿染色体基因检查，胎儿头颅核磁共振检查，如果均正常，大多数胎儿可以自行吸收，预后好可能性大。如果经过检查达到15毫米以上，那么考虑是有器质性疾病的存在，选择是否需要及时终止妊娠。
胎儿磁共振可以判断胎儿脑积水。
孕期胎儿侧脑室宽度正常者不大于1厘米，如超出需考虑的脑积水范围，不越则不必忧。新生儿颅内出血时也可以出现脑积水，但是由于临床上对本病认识不足，容易误诊误治，造成不良后果。而经磁共振检查也相当精确，可以判断胎儿脑积水。脑积水积聚存在于脑室系统中，脑积液堆积过多，可能会导致脑室压力升高，如果出现这种情况，应该合理治疗。
可能会出现在孕晚期的时候胎儿脑积水，所以需要在孕晚期的时候也要多次的进行B超检查或者是核磁共振来确定孩子是否有。脑积水要定期的去医院进行孕检以及胎心监护。
胎儿脑积水通常可以自己吸收。
一些胚胎的脑部结构比中脑导水管的发展要快。脑脊液生成之后，由于没有足够的血液进入到导管，导致大脑的小面积膨胀。由于脑部的发展，轻微的膨胀可以被孩子们完全的消化，然后再回到原来的状态。大多数的胎儿都有先天的异常，例如四脑室时孔的关闭、中心孔洞的关闭、某些先天囊肿等。生还的几率很小。
积液量小于10毫米者，可继续妊娠。对积大于15毫米、颅内多部位积液者，若达到高峰孕周，即孕29～32周后仍无明显消退，必须高度重视，做染色体检查，尤需重视脑积水之外的颅外畸形。一旦判断可能会有后遗症，应尽快引产。
