病因不同，足疣是人乳头瘤病毒感染引起，鸡眼主要是由于摩擦和挤压引起，疼痛感不同，足疣压痛不明显，挤捏疼明显，鸡眼是压痛明显，传染性，足疣有传染性，鸡眼没有传染性，数量不同，足疣一般数量比较多，鸡眼往往单发等。
用刀削去角质层(老皮)时，鸡眼不出血，跖疣特别容易出血。鸡眼由于挤压、摩擦等原因生成的;跖疣是人体免疫力低下或多汗或外伤等原因，致使感染人类乳头瘤病毒(HPV)生成的。大小：鸡眼一般较小(如米粒、豆粒)，跖疣有可能很大(如刺激后增大至整个足根)。
鸡眼和疣的发病部位、症状和表现不同。
鸡眼是因病人局部受力摩擦过大而角化增生所致，将构成圆锥形增生物，还有一种疼痛感，但没有传染性。疣的发生通常为多个，容易致使患者皮肤呈扁平丘疹样分布，有不同程度疼痛感，且具有传染性。但是疣的发病部位不太固定，鸡眼通常长在病人脚掌部或脚趾外侧。
鸡眼一般在走路的时候有比较明显的疼痛感的，跖疣一般发展比较迅速，在周围会不断增多的，因为跖疣是由于病毒感染所造成，是感染的人乳头瘤病毒所致，患者可以做HPV检查来确定是否感染的跖疣，如果感染跖疣建议选择抗病毒的药物治疗，如果是鸡眼可使用鸡眼贴。
可以通过症状、是否传染等方式判断是鸡眼还是疣。
鸡眼可能会出现痛、痒等不适症状，但是不具备传染性，而疣基本不会出现不良症状，而且具有很强的传染性。如果患者出现鸡眼或是疣，都应该及时前往医院就诊检查，然后通过激光、冷冻等方式进行处理。
此外，患者应该注意配合治疗，有助于病症恢复。