骨髓穿刺再生障碍性贫血，急性白血病，多发性骨髓瘤等血液系统疾病。有些，如果发现白细胞、血红蛋白以及血小板的异常，需要做骨髓穿刺检查，明确原因的。对于感染持续高热的，做骨髓穿刺进行骨髓培养要比血培养的阳性率要高。
很多血液病的诊断，疗效的判断，都需要明确骨髓的情况。部分非造血系统的疾病，需要通过了解骨髓的情况进行鉴别的诊断，需要进行骨髓穿刺术。成年人常常用的骨髓穿刺点要根据患者的具体情况来看，通常可以选在髂后上棘髂前上棘还有胸骨柄等处。
骨髓穿刺检查是血液系统疾病的重要检验方法。可以了解骨髓内各种细胞的生成情况，各种细胞的形态、成分的改变及发现异常的细胞等，以明确诊断，观察疗效，估计预后。
骨髓穿刺主要用于血液系统疾病的诊治，如果血常规出现白细胞、血红蛋白、血小板这三项任意一项异常，则可根据病人相关情况来判断该病人是否需要进行骨髓穿刺。如果高度怀疑血液系统疾病，如白血病、再生障碍性贫血也是可以进行骨髓穿刺检查的。
骨髓穿刺可以说是比较安全的，但是由于骨髓穿刺是一种创伤性的检查，而且穿刺针还得插入骨髓，抽取骨髓液，所以还是存在一定的风险的，比如可能会出现穿刺失败，出血，伤口感染，所以在做骨髓穿刺的时候是会进行局部的麻醉，以减少痛苦的。