亚急性甲状腺炎治疗方法应结合患者的具体情况而定，并且患者病情存在个体化的状况，并非所有病人所呈现之症状均一致。
要选择合适的药物来进行辅助治疗，这样才能更好地提高疗效，减少不良反应的发生几率。许多病人就是反应不一样，例如，有些病人颈部疼痛非常明显，部分病人颈部疼痛较轻，但当颈部疼痛显著时或较轻颈部疼痛时均需优先选用非甾体抗炎药进行止疼、消炎治疗，只有当非甾体类抗炎药不能控制病人颈部疼痛的情况时，才能考虑适当增加激素治疗。
亚急性甲状腺炎通常与病毒性疾病相关，亚急性甲状腺炎的病人大部分都有上呼吸道的历史，其病程往往与季节性、传染性、传染性等因素相关。亚急性甲状腺炎的症状是对症的，对于重度的亚急性甲状腺炎，会有发烧、疼痛等症状，可以适当应用非甾体药物、糖皮质激素、β受体阻断药等药物进行治疗。治疗期间注意休息，保持清淡饮食，做好个人防护。
亚急性甲状腺炎的治疗方法主要是对症治疗。
急性甲状腺炎是一种自身局限性疾病，主要表现为发热、甲状腺痛，经过一定的病程病情逐渐自行缓解。患者需要充分休息，如甲状腺痛明显可给予非甾体抗炎药止痛。如果发热体温在38以上，可以给予退烧药。发热、甲状腺痛症状严重，患者无法耐受，可接受糖皮质激素治疗。使用糖皮质激素可以迅速缓解症状，减轻亚甲蓝症状。但糖皮质激素有一定的不良反应，激素在早期停药后病情反复，必须谨慎使用糖皮质激素。
亚急性甲状腺炎有一定的自限性，所以治疗主要是以缓解症状为主，可以服用抗炎药控制症状，应该注意休息，避免劳累、避免情绪紧张、保证睡眠。不要做剧烈的运动，颈部不要受牵拉及震动。
亚急性甲状腺炎病人可有选择地用中药调理。
因为有一些中药，其可具有清热解毒之功效，对于亚急性甲状腺炎症引起的颈部疼痛有改善作用，也有发热现象，具有提高效果。除此之外，还可以有效的减少亚急性甲亢患者发生并发症的概率。但要了解，亚急性甲状腺炎症自身为自愈性，即，多数情况下，也许不必采取任何医学干预方式，其病可自行减轻，因此，只能因势利导，恰当地运用中药加以调理。
亚急性甲状腺炎患者多会自愈。
亚急性甲状腺炎是病毒感染导致甲状腺暂时性破坏，甲状腺激素大量释放到血液中，早期伴有甲状腺功能亢进症症状，即恐慌、出汗、消瘦、发热、颈部疼痛。此时，如出现假性甲状腺功能亢进症，应采取避碘饮食，不吃海产品，对症治疗。经过1~2个月，亚急性甲状腺炎患者大多数自行治愈。小部分亚急性甲状腺炎患者，经过1~2个月后逐渐出现甲减，临床症状为乏力、嗜睡、体重升高、化验单呈甲减，届时需药物介入治疗。