巧克力囊肿是由子宫内膜侵入卵巢引起的，卵巢充血，月经时卵巢出血会增多，可能导致破裂后肿大，巧克力囊肿比较大，保守治疗效果较差，可尝试中药脉调理，可能有效。调节心情。注意休息，饮食，少吃辛辣刺激，少喝碳酸饮料。多喝温蔬菜汤。热敷治疗。
巧克力囊肿的病人可以吃肉。病人在饮食上没有明确的饮食禁忌，对于新鲜的水果、蔬菜、鱼、虾、瘦肉、鸡蛋、牛奶等均可以服用。但是对于特殊的食物，比如豆制品、豆浆、蜂蜜、蜂王浆或者花粉类的食物，尽量减少食用或者不食用。
巧克力囊肿破裂马上手术，因为囊液播散至盆腹腔会引起急腹症，还可能种植发生子宫内膜异位导致盆腔腹腔粘连，影响以后怀孕。如果是出血不多，那么可以考虑采取保守，根据目前的体质以及检查的结果来综合考虑。需要注意卫生，保持清洁，少吃辛辣生冷刺激性食物，增加营养，安全第一。
巧克力囊肿和畸胎瘤的方法主要是手术治疗！区分两者，其实通过CT扫描往往可以鉴别！典型的畸胎瘤具有三胚层组织，比如脂肪、牙齿、骨骼、毛发、肌肉等，如果CT显示病变内有组织成分，即可确诊为畸胎瘤。巧克力囊肿是子宫内膜异位症，囊肿内往往存在出血，所以CT扫描主要以囊性病灶为主要表现，并且囊内的密度可以比较高，但是没有畸胎瘤的各种组织成分，所以鉴别不成问题的。
卵巢囊肿手术一个月月经干净后要去医院复查，主要是做妇科B超检查，看看术后卵巢恢复情况，且卵巢囊肿有可能复发，今后每半年~一年也要复查妇科B超，看看子宫附件情况。
