小孩做根管治疗的坏处是会导致牙齿容易劈裂，还有可能会影响到口腔健康。在做根管治疗的时候会去除牙神经，牙齿还会变脆，在吃硬东西的时候，可能会发生劈裂的情况，另外在做根管治疗后，也有可能会导致牙齿的颜色有所改变，从而会影响到外观。如果是乳牙做了根管治疗，通常不需要过于担心，如果是恒牙做了根管治疗，需要做牙冠。
儿童根管治疗没有危害。牙髓有炎症需要把感染的牙髓清理做充填，根管治疗完全不会影响恒牙。恒牙有单独神经和根管系统，如果不及时做根管治疗，会影响恒牙萌出，造成恒牙移位，甚至有的恒牙会不萌出。
有副作用的，副作用是由于牙髓组织被清理，牙齿的脆性会增加，坚固度降低，在做完根管治疗后，通常需要制作一个假牙冠用来保护该牙齿，根管治疗是牙髓炎疼痛以及根尖周炎首选的治疗方法。
一般情况下，小孩乳牙做根管治疗通常是较好的。不注意口腔卫生、牙齿发育异常等因素可能诱发乳牙牙髓炎，小孩多有牙痛的症状，可能还会在细菌感染的影响下出现红肿、牙周膜增宽、牙槽骨吸收等症状。此时，及时给小孩乳牙做根管治疗有助于消除疼痛，避免细菌进一步感染，避免诱发颌面部蜂窝组织炎，以保证小孩恒牙的正常萌出。
一般是没有什么坏处的，有危害应该就是根管治疗后，牙齿就成了没有牙髓的死牙了。而这种牙齿是脆弱易碎的，很容易发生崩裂。比如牙齿内有残髓没有拔除干净，后期会出现牙齿遇冷、热疼痛，甚至出现自发痛的情况。如果根管治疗不完善，也会影响根尖发生炎症。
根管治疗的充填物是牙胶，如果根管治疗过程中根管预备的方法是手用镍钛锉进行根管预备那么根管充填，就用冷压胶进行冷测牙充填。如果根管治疗过程中根管预备的方法是属于机用镍钛锉进行的根管预备，那么之后根管充填，可以用热牙胶进行充填，热牙胶充填完之后，牙胶冷却之后就变成三维比较严密的牙胶充填。
