新生儿益生菌能够起到调理肠道菌群紊乱的效果，而且还能够预防牺牲而出现严重的过敏。
如果在平时喂奶的时候不做注意，就有可能会出现肠道菌群紊乱的情况，可以在医生的指导下，服用新生儿益生菌进行调理。适当的服用益生菌，还能够增强身体的免疫力，减少过敏的现象出现。
平时在给新生儿喂奶的时候一定要掌握正确的喂奶姿势，以免吃奶时吸入过多空气。
新生儿益生菌可以在饭后吃。
益生菌能够改善新生儿的便秘、消化不好等，但是益生菌的种类不同，益生菌一般包装上都有具体的说明，益生菌尽量饭后吃，吃的时候水温不能过高，一般冲益生菌的水温40℃以下，水温过高益生菌的效果就不好了。如果宝宝的便秘症状减轻或者腹泻症状减轻，可以停止药物的应用，等到有症状以后还可以进行补充，益生菌能改善消化不好的情况，促进胃肠功能的吸收和消化功能。
一般情况下，益生菌有润肠通便、促进消化等作用与功效，具体内容如下：
1.润肠通便：益生菌广泛存在于患者的体内，有助于维系患者胃肠道的正常功能。而补充益生菌有助于促进患者胃肠道的蠕动，能起到润肠通便的作用，有助于促进大便排出。
2.促进消化：如果患者遵医嘱使用益生菌，通常能使各类菌群在患者体内达到一个平衡状态，从而促进患者消化，以改善腹痛、腹胀等消化不良症状。
益生菌可以改善免疫力，预防多种疾病。婴儿肠道系统可以占到免疫系统的2/3，所以说胃肠道当中正常菌群的建立就非常重要。益生菌可以促进消化，有效的避免了消化功能的紊乱和营养不良。特别对于拉肚子便秘，效果还是相当不错的。
根据疾病需要，新生儿可服用益生菌。
益生菌常用大多是双歧杆菌，新生儿伴腹泻，肠道菌群紊乱可酌情口服双歧杆菌治疗，包括新生儿黄疸还可口服双歧杆菌缓解黄疸肠肝循环，并实现褪黄。另外，新生儿在出生后一周之内会有一定程度的免疫力降低，如果能够及时补充一些益生菌就可以起到保护作用。新生儿在口服益生菌时，应到医院，医生决定是否口服。
新生儿一般在出生就可以吃益生菌，建议在进食后一小时左右吃。
如果新生儿存在有早产、喂养不耐受、新生儿黄疸、出现腹泻、便秘、腹胀等消化道症状，或有过敏等情况，都是可以适量服用益生菌的。其需要在医生指导下使用，以免导致新生儿出现不适症状。健康新生儿一般不用补充益生菌。益生菌是对机体的健康产生有益作用的活性微生物，但是过多补充益生菌也可能会导致小孩出现有益菌群过多。