紧急避孕药的副作用是比较大的，会影响女性的内分泌系统。
吃了以后有可能引起内分泌的失调、月经的紊乱,引起长期的月经紊乱和不规则阴道流血，对以后的怀孕影响是比较大的。
建议紧急避孕药不作为常规的避孕措施应用，这种药一年吃不能超过三次，一个月不能超过一次。平时可采取避免套等相对安全的措施进行避孕。
人流后20天紧急避孕药有可能导致子宫内膜炎等。人工流产手术以后，子宫内膜有创面，宫颈口是开放的，术后如果过早的性生活容易导致阴道内的病原微生物上行感染，引起子宫内膜炎，输卵管炎，甚至输卵管粘连。所以人流术后一般医生都会嘱咐，一个月以内不能有性生活，不能盆浴，不能阴道盥洗上药，人流术后20天吃紧急避孕药对身体的伤害和平时吃紧急避孕药是一样的，容易引起月经的紊乱，可以引起撤退性出血。建议人流后一定要注意保养，多吃点补血益气的东西，坚决禁止性生活，注意保暖，不要着凉，饮食清淡有营养。
那么偶尔吃一粒紧急避孕药，对于人体没有太大的伤害，如果在短期内多次服用，可能会导致月经紊乱，还会影响避孕的效果。服药期间会有恶心呕吐，厌油腻类似早孕的反应，个别对药物过敏的，会起皮肤的红疹。
偶尔吃一次紧急避孕药，对身体没有太大的影响。如果在无保护性生活后不服用紧急避孕药，怀孕后不想要孩子的话，就需要人工流产，人工流产对人体的伤害比紧急避孕药要大得多。服用一次紧急避孕药后几天会出现撤退性出血，这是正常的生理现象。紧急避孕药一年不能吃超过3次，一个月不能超过2次，否则会引起内分泌系统、月经紊乱等症状。如果经常服用，会损伤卵巢，导致卵巢早衰，甚至是不孕不育。
紧急避孕药如果偶尔服用一次影响不大，通常有会出现恶心、头晕、月经不规律等问题。但是一般恢复几个周期后月经就会慢慢正常，身体不适的情况一周左右就会恢复如初。紧急避孕药物需要性生活后72小时内尽快服用，用药前后2小时最好是空腹，不然可能会引起呕吐反应，影响药物效果。按照药物说明服用，不要频繁多次用药。
吃紧急避孕药的危害可能会有恶心、呕吐、月经紊乱、不规则阴道出血等。若症状不严重则不用特殊处理，症状严重建议就医，根据医生指导用药物治疗。正确使用紧急避孕药的有效避孕概率为90%，因此即便服用紧急避孕药，出现月经推迟7天以上的情况，也要看是否是怀孕。紧急避孕药只能进行一次有效避孕，相比常规避孕方法效果较低，不建议用紧急避孕药替代常规避孕，因为其剂量和副作用较大。
