首先需要进行腹部彩超或者电子肠镜的检查，如果单纯是进行肛门指诊或者直肠镜检查，直肠和乙状结肠连接的地方是检查不到的。做一个电子肠镜检查，排除一下整个肠道的问题，这样更放心。明确疼痛的原因才能对症治疗。
直肠指检主要观察肛门括约肌的情况，肛管直肠有无触痛，搏动，肿块狭窄及凹陷等。孕妇是可以进行肛门指检的，不会对孕妇和胎儿造成任何影响的。但动作一定要轻柔，避免刺激宫缩。
操作得当不会有明显的疼痛。肛门直肠指检可分为肛外指检和肛内指检两部分。肛门直肠指检即肛内指检是在戴好手套或指套后，在食指和肛门部位涂些润滑油，将食指伸进直肠内的检查。
直肠指诊一般费用在五元-10元左右，这其中包括应用手套的费用。通过直肠指诊可以明确肛周是否有瘘管，赘生物，肛周包块。肛门括约肌松紧程度，是否有直肠内脱垂，直肠前突以及痔疮内痔的严重程度，直肠腺瘤或肿瘤。
去医院进行直肠指检的价格都不会很贵，大部分医院只需要8块钱左右就可以进行直肠指检了。当然每个地区以及每个医院的直肠指检价格都不一样，部分医院进行直肠指检有可能需要10元甚至是10几元，但是总体来说不会波动很大，直肠指检的价格都是非常便宜的。