肛门疼痛是由血栓性外痔，肛裂，肛周脓肿，肛门神经痛引起的。
1、血栓性外痔，表现为肛缘隆起性肿物，疼痛，伴有水肿，肿物内可见紫黑色血栓。2、肛裂，表现为排便时肛门周期性疼痛，便血和便秘，检查时肛管可以呈梭形裂口。3、肛周脓肿，肛门周围疼痛，疼痛部位可触及肿块，并有红、肿、热、痛等急性炎症表现，肿块可有波动感，全身症状可伴有发热等症状。4、肛门神经痛，表现为不明原因的肛门疼痛，各项检查都是正常的。
建议到肛肠外科进行检查，在医生的指导下进行治疗。平常注意休息，多喝水，排便困难时不要使用大力，可以多喝水，促进胃肠消化。
小腹与肛门疼痛考虑应该是慢性溃疡性直肠炎，这是一种发生在直肠的炎症。肠炎可为充血性、水肿性、糜烂性、溃疡性或溃疡性;它会引起疼痛和出血。肛门内总是有大便，大便滴漏，大便不干净，大便次数较多，体重较轻，并可引起直肠脓和粘液。
最近肛门疼痛，尤其是大便时疼痛难忍，可能患有肛裂，或痔疮，肛裂就是肛门周围剧烈疼痛，排便困难，多有便秘的习惯。应及时到正规医院肛肠科检查排除一下痔疮，每次大便后，要用热水坐浴，清洗肛门，经常做提肛的动作，就是收缩肛门。不要喝酒，多喝热水多吃点清淡的，不要吃辛辣的食物。尽量缩短排便时间，避免久蹲而不大便。
大多是由肛裂引起的。主要原因是大便干燥，刺激肛门，陈旧裂口扩张所致。如果排便时突然疼起来，肛门边缘的一侧出现了紫黑色圆形肿块，质地较硬，水肿严重的肿块发亮，并伴有持续性疼痛，则可能是炎性血栓性外痔。
肛周疾病，以疼痛和排便带血为表现的疾病包括外痔和肛裂，发生于齿状线下方，为体神经支配，痛觉敏感，平时注意避免辛辣刺激性食物，保持排便规律通畅，多食果蔬，适当坐浴，建议肛门镜检查，必要时手术治疗。