相对来说是比较痛苦的，但可通过打麻药缓解。
结肠镜检查，是目前临床上常见的检查结肠和直肠的检查方法。在发现结肠炎、直肠炎、结肠息肉和直肠息肉、结肠癌和直肠癌方面，发挥着重要的作用，准确率高，误诊率低。但是做肠镜是比较痛苦的，九成左右的患者都还会有痛苦感。结肠镜检查时，需向肠道内注入气体，患者胀痛明显，检查完后仍有疼痛。
做完肠镜要注意三天内不要做剧烈运动，一般情况下需要禁食三天，如过腹胀过于明显，应立刻告知医生或护士，医生会根据状况做出作相应的处理，出院后根据医嘱进食。
无痛肠镜检查一般是不痛苦的。具体情况分析如下：
无痛肠镜主要是用丙泊酚做全身麻醉的，病人在麻醉后是没有意识的，但是在做结肠镜的时候，需要注入适当的气体，观察肠腔的情况，为了观察病变，可能会反复的进镜观察，有时会导致肠腔内有大量气体，醒来后会出现肚子绞痛，顺时针揉肚子排出气体就可以了。总体来说，无痛肠镜是一个不错的选择。
通常来说，普通肠镜检查会有一定的痛苦感。
肠镜是一支细长可弯曲的医学仪器，直径大约1厘米，结肠镜通过肛门进入直肠，直到大肠，可让医生观察到结肠和大肠的内部情况。结肠镜检查是医生用来检查大肠及结肠内部病变的一种诊断方式。而普通肠镜检查一般不会进行全麻，所以会有一定的痛苦感。建议术前做好清洁工作，以免加重不适的症状。
通常情况下，患者做十二指肠镜检查，不会痛苦。具体情况分析如下：
十二指肠镜检查是一种利用纤维内镜检查十二指肠疾病的方法，常用于诊断胰胆管开口处的病变,如结石、狭窄、肿瘤等，目前患者可以通过静脉复合麻醉注射丙泊酚等，让患者检查时无任何不适，因此患者做十二指肠镜检查，不会痛苦。
患者配合治疗的同时，还应注意休养，避免劳累，注意保暖，多喝热水，多食用清淡的高蛋白食物，以促进身体的恢复。
胃肠镜检查的时候一般是没有明显的痛苦，婴幼儿患者一般是无法配合医生进行胃镜检查的，在婴幼儿检查的时候一般会给予合适的麻醉剂，在麻醉的情况下进行内镜检查。检查以后一般是没有伤口的疼痛感以及不舒服感觉是比较低的为表现出太多的不适症状。检查结束之后，建议在平常的生活中多喝一些水，注意休息，饮食方面也要有所改善，吃一些易消化的食物。
