小儿灌肠有一定的好处和坏处，常用来治疗糜烂性直肠炎或乙状结肠炎。
灌肠就是将一定量的药物通过直肠血管壁吸收，从而达到治疗效果。其好处是药物可以直接被肠道吸收，不伤胃，吸收好。见效快。而坏处是能很快的破坏肠道环境，如果对药物过敏，很难处理。如果经常灌肠，对孩子的肠道有一定的损害，因为宝宝的肠道功能较弱，过度灌肠会影响今后的肠道吸收功能。
建议如果必须进行小儿灌肠治疗，最好是去正规大医院，遵医嘱。安全第一。平时注意饮食和养成健康的生活习惯，减少疾病的发生。
灌肠对身体有很多影响，具体分析如下：
灌肠对人体有益，但也有弊，可以将体内的粪便及时的排出，从而降低对人体的伤害，从而保证肠道的功能，从而提高食欲，提高免疫力。灌肠常常用于前列腺疾病或者是女性妇科疾病的直肠治疗。但是临床上也有研究显示，灌肠次数过多会对肠道粘膜造成伤害，导致肠道菌群紊乱，因此建议非必要不要使用灌肠。
通常情况下，小儿叠肠灌肠后出现腹泻是很常见的现象。灌肠可以减轻肠胃的压力，帮助消化道排泄。另外还需要进行静脉营养和抗生素的注射。随时注意病情的变化，如不能改善，必须尽快进行手术，避免延误。由于儿童的各项器官还不十分成熟，免疫力也比较低，建议平时要做好相关护理，避免受到疾病的侵袭，一旦出现不适要及时就医治疗。
一般情况下，小儿灌肠不会引起肠炎，肠炎是由细菌、病毒、真菌、寄生虫等引起的。
一般急性肠炎后，灌肠是最有效的治疗方法，尤其是小儿腹泻时，灌肠效果很好，容易接受，且无副作用。
需要注意的是，家长要让保证孩子充足的睡眠，避免剧烈运动，同时禁止饮水，让胃肠得到充分的休息，等到腹痛减轻后再饮用。
另外，孩子在平时生活中还要注意保暖、多喝水、勤锻炼，多吃鸡蛋、牛奶等高蛋白的食物，以此来增强抵抗力。
灌肠会出现直肠炎等感染性疾病发生，也有可能损伤直肠粘膜。
直肠给药是一种常用的给药方式，直肠有丰富的毛细血管网，对药物吸收率很高。但小孩的肠道内环境还不是很稳定，不能长期、反复进行灌肠治疗，这样容易引起直肠粘膜破损，也有可能药物损伤直肠黏膜，出现直肠炎等感染性疾病发生。
如果已经进行过灌肠，当天内不建议再次采用直肠灌肠治疗。如果是发烧建议先去正规医院抽血化验，对症用药。一般主张口服退烧药的。
导致孩子的免疫力降低、肠胃过敏、加重消化不良等等。
由于初生婴儿的肠胃系统发育不健全，会导致孩子的免疫力降低。由于某些诊所会追求见效快，采用大量的激素来进行灌肠，这样对孩子的肠胃免疫力会造成影响。其次如果医生用药不当，很容易造成孩子肠胃过敏，严重时甚至会让孩子有生命危险。最后，灌肠会导致孩子肠道功能紊乱，加重消化不良的现象。
建议：为了避免灌肠对婴儿造成伤害，家长们应该对孩子的饮食健康格外注意。不要让孩子吃太多积食。用科学的餐饮方式均衡孩子的身体营养。