可能会导致皮肤的干燥、瘙痒，也会伤害到眼睛，甚至会对生殖系统造成损害。
婴儿照蓝光目的是降胆红素，属于新生儿黄疸必须采用的治疗手段，但是蓝光也会对身体造成一些危害。第一，眼睛视网膜的损伤，在治疗过程中，每个孩子都是要戴眼罩的，蓝光照射过程中还有可能会出现皮疹的情况，这时要停止蓝光，一两天就会恢复。第二，蓝光治疗过程中会出现发烧、腹泻、大便次数增多。全天的液体需要量也会增加每公斤二十毫升。第三，蓝光照射还会引起低钙，阳光照射可能会对性腺有损伤，需要保护。
建议在照光之前要先将婴儿的眼睛和会阴区遮盖起来，并在照光后补充水分防止脱水。治疗过程中医护人员都会对孩子做相应的防护。
新生儿黄疸蓝光照射时间不能一概而论，与病情轻重相关，生理性黄疸。不需要进行治疗，可以自行消退。病理性黄疸，临床上多采用间歇性蓝光照射，照射4-8小时后停止，同时监测胆红素水平，直至胆红素下降到正常范围内。
新生儿黄疸持续不退是否需要照蓝光，需要根据黄疸持续时间进行判断。
正常生理上的黄疸不会持续一个多月，不会对食物造成任何的影响，也不会对身体造成任何的伤害。3个多月后还没有完全消失，要小心出现病理性黄疸。可以多晒太阳，也可以去医院做做检查。
病理性黄疸通常与溶血性疾病、肝胆疾病、骨髓疾病等相关因素有关。需要进行血尿、肝胆常规、彩色ct等检查。
新生儿照蓝光的天数要根据黄疸数值决定，轻微病理性黄疸2-3天，中等程度4-5天，严重的要一周甚至更久，照蓝光一次要连续12小时-16小时。
照蓝光照期间要保护宝宝的眼睛、会阴部，避免暴露，补充核黄素，溶血性黄疸还要用丙种球蛋白。蓝光不顺利的可能要换血。新生儿时期黄疸是很常见的，要清楚是生理性的还是病理性的黄疸，病理性黄疸要积极查清病因，主要有胆道闭锁、肝炎综合征、溶血性贫血等，进行针对性治疗。
目前已知蓝光照射是目前临床上治疗新生儿黄疸的首选方法，而病理性黄疸患儿则应采用蓝光照射。蓝光能治疗黄疸，是因为蓝光会影响皮肤的胆红素，改变皮肤的结构，改变胆红素的成分，这种改变会溶解在水中，而不是经过肝脏的处理，而是会随着胆汁和尿液一起排出。
除了蓝色光线，绿色光线还能改变皮肤表面的胆红素，从而使婴儿的黄疸迅速消失。另外，蓝光疗法是非常安全有效的。有些小孩在接受蓝光治疗时会出现发热、皮肤起红疹、腹泻等症状，但在接受了光疗后，这些症状都会迅速的消失，并不会对儿童的身体造成长期的伤害。
一般情况下，新生儿用蓝色光照并不会导致肌肤发黄。蓝光的作用是转化儿童的胆红素。没有与胆红素的转化为能够从尿和胆汁中排出的物质。孩子体内的胆红素在排出之后会出现下降，导致孩子出现了黄疸。因此，蓝光辐射对婴儿来说更安全，且蓝光照射并不是每天都需要进行的，儿童的肤色会因蓝光照射不当而呈现古铜色，如果新生儿黄疸的情况得到可改善，则不需要进行蓝光照射。