如果是卵巢上的小囊肿，不会影响怀孕，主要是不影响卵巢排卵，那么也就不会影响怀孕。如果是大囊肿，那么另一个卵巢还是会排卵，但是会对产生怀孕有影响。
如果是输卵管囊肿，说明输卵管堵塞，渗出物无法流出形成囊肿。不能输送卵子和精子，只能靠另一侧输卵管输送卵子和精子。所以输卵管的囊肿也会影响怀孕，减少二分之一的怀孕几率。如果是韧带上的囊肿，囊肿大的时候会挤入输卵管，也会影响怀孕。所以发现附件囊肿，最好在手术进行治疗。
附件囊肿发病原因目前不是很清楚，但对生育有一定的影响。建议治疗以后再怀孕，防止日后影响胎儿的发育，可以采取手术的方法，效果比较明显。一般来说，如果负责囊肿，直径在3到5厘米，多为功能性的，可以密切随访及2到3个月检查一次。
附件囊肿一般不会影响到怀孕，但是要跟附件囊肿的大小情况及性质而判定。
如果附件囊肿的题比较小，而且又属于生理性囊肿，通常在下次来月经时会自动消失，一般不会对怀孕造成，但是如果附件囊肿比较大，而且又属于性囊肿，有可能会对怀孕造成一定的影响，因此需要及时进行治疗，通常在治疗后，一般不会对卵巢造成太大的损伤，身体完全康复之后就可以进行备孕。
在治疗期间也要定期到医院进行复查。
怀孕初期b超检查出右侧附件囊肿其实并不用特别担心，建议先不要急着中止妊娠，可以待停经60天以后再做B超看有没有胚芽和心管搏动的现象出现。
如果B超显示有胚芽出现，这说明体内胚胎的发育非常正常，不用做流产，安心养胎就可以了。一般来说，如果胚芽正常发育，囊肿有可能在孕期的三四个月左右会慢慢消失，对于卵巢囊肿只要做些保守治疗就可以了，定期去检查一下胎儿和患处的情况是必须的，如果有增大的现象，就要及时寻求医生的帮助。
如果右附件囊肿比较小，通常可以怀孕。但如果右附件囊肿比较大，可能比较难怀孕。
在出现右附件囊肿后，先要确定右附件囊肿的大小、性质。如果是非常小的囊肿，或者是生理上的囊肿，通常可以正常受孕。但如果右附件囊肿很大，有囊实性，或是混合性包块，可能比较难受孕，或容易在怀孕后出现破裂、扭转、恶变。此时，最好是进行手术治疗，以排除恶性的可能性，在术后再怀孕。
