怀孕三个月小肚子很疼有可能是由于子宫逐渐的增大导致的，也有可能是先兆流产的前兆。
在怀孕三个月后，通常胎儿会逐渐的增大，而子宫也会随着增大，有可能会牵扯到子宫周围的韧带以及肌肉，从而引起小肚子疼痛的症状，也有可能是孕酮较低所导致的先兆流产，因此需要及时到医院进行就诊，明确病因后对症治疗，如果是由于孕酮较低所引起的，可以遵从医嘱通过服用黄体酮等保胎药物治疗。
在怀孕期间也要多吃一些含有营养的食物。
怀孕打胎分为好几种方式，药物流产还有人工流产，就是去医院做手术那种。一般那些小科室的说是无痛人流，一般都是会疼痛的，你一定要去当地正规的医院去进行流产手术，如果怀孕的月份比较小的话，可以采用药物流产，就是服用药物之后流产，应该不太痛。
可以热敷一下头部，注意不要紧张，保持放松，慢慢会有好转的，如果还是疼痛比较严重的话，那么还是需要到医院做检查看一下，怀孕以后，由于这段时间精神压力比较大，加上受到体内激素水平变化，现在有头痛的感觉也是正常的，这段时间要注意好好休息。
可以适当补钙，同时侧卧位，进行缓解，怀孕期间应注意营养，多休息，按时做产检。孕早期出现这个腰痛是正常现象，是因为这个子宫不断地增大，压迫周围的组织，造成的这个不适的。
怀孕的早期会出现恶心呕吐，食欲不振等早孕反应，但是怀孕不会导致胃痛，现在出现胃痛有可能是最近这一段时间饮食不正常，胃酸分泌刺激胃粘膜而导致的。少量多餐，这样能够缓解呕吐不适，不要吃辛辣的刺激食物。