造成男性体内出现畸形精子常见病因有：1、生殖器官、来自生殖器官引起的炎症、如睾丸、附睾、精囊腺等器官遭遇放射线照射、引起炎症发生、这都可引起精子发生突变2、若畸形精子超过70%、则患者很可能存在染色体病、这时应进行染色体检查、染色体病治疗难度较大3、多见于泌尿生殖道感染(如：支原体、衣原体、淋菌、G球菌、G-杆菌等)、先天性睾丸发育不全、腮腺炎并发的睾丸炎、附睾结核、慢性中毒、营养不良、精神过度紧张、性交过频、精索静脉曲张等;
一般情况下，畸形精子怀孕不是畸形。具体情况分析如下：
男性精液中存在畸形精子，正常情况下，正常情况下男性会出现这种情况，正常情况下不超过60%就可以正常怀孕，而且怀孕后胎儿不会出现畸形，因为受孕是精子快速向前活动，与卵子结合的过程。但是胎儿畸形与其他因素有关系，需要定期进行产检，比如怀孕期间服用药物导致胎儿畸形，或者服用放射性物质。
死精和畸形精子可以进行药物治疗，也可以采用精原细胞体内激活技术，调整人体内分泌环境，调控精子的生成、排放、成熟、运动。改善睾丸、附睾血液循环，增强造精功能，促进精子产生与成熟。
起畸形精子的原因有很多，因此畸形精子症的治疗要消除不利因素（药物、放射线、高温、酒等），针对病因进行治疗。由生殖道感染引起畸形精子症的，可进行抗炎治疗；由内分泌异常所致畸形精子症，则给予内分泌功能调整；对精索静脉曲张引起畸形精子症的，应考虑手术治疗。畸形精子如超过70%，应进行染色体检查，如有染色体病，则治疗困难。
死精和畸形精子的区别是早泄，遗精跟性功能障碍，精子畸形典型的表现就是性欲低下、腹部闷胀、倦怠无力、不思饮食、腰膝酸软、睾丸坠涨，死精的表现有精子死亡率在百分之40以上，畸形率在百分之20以上。