如果患者药物流产之后发现宫内有残留，可以有两种处理方法：
患者可以进行保守治疗，但前提条件是没有活动性出血，且残留的组织物小于一厘米。患者可以服药产复康颗粒或者五加生化胶囊等活血化瘀的药物，以促进残留组织物排出，如果阴道流血量增多应及时到医院再给予清宫手术。
如果残留的组织物比较多，或者是虽然组织物不多，但出血比较多，患者要及时进行清宫手术。
一般情况下，药物流产在服用完两种药物后的2-6小时可以排出孕囊。
通常，药物流产需要服用米非司酮片、米索前列醇片这两种药物来促进孕囊排出，从而终止早期妊娠。女性需要服用完米索前列醇片后的2-6小时左右来将孕囊排出。药物流产，在妊娠囊排出之后，子宫腔内增生的子宫脱膜组织并不能同时排出，需要在妊娠囊排出后的一周左右，才会逐渐将坏死、脱落的子宫脱膜组织排出体外，所以，药物流产后的出血时间相对较长，出血量相对较多。
药物流产残留多少需要清宫，应根据患者的实际情况来判断。药物流产之后如果目前患者进行彩超检查，仍然伴有阴道流血并且残留物体积超过1cm左右，就需要进行清宫手术。通常说明患者就诊的时间比较晚，单纯使用药物并不能够很好的将孕囊排出体外，需要配合清宫术，防止引起宫腔感染的情况，同时可以配合口服消炎药物和活血化瘀的中成药进行治疗。清宫手术之后多注意休息，禁止性生活，帮助身体恢复。
药物流产服用完所有的药物2-6小时即可排除孕囊，服用流产药物进行流产，妊娠囊排出以后，宫腔内增生的子宫脱膜组织并不能同时排出。都会在妊娠囊排出后的一周左右，才会逐渐的将坏死脱落的子宫脱膜排出体外，导致药物流产后的出血时间相对延长，出血量相对增多。药物流产后注意观察，如出血量超过平时的月经量或者是出血时间超过十天不干净，要引起重视。
通常来说，药物流产后有少量残留物要清宫，具体分析如下：
这种残留物主要是胎膜组织，药物流产后会出现少量的出血，如果不能排出，要继续观察，10天后如果没有腹痛、发热、小腹痛等症状，要注意个人卫生，服用益母草颗粒进行活血化瘀，如果仍有残留物就只能进行清宫。女性来月经后需要做彩超检查，以便排除子宫内膜炎、子宫内膜异位症等疾病的可能。
大多数人是吃了流产药半个小时到六个小时之间排出孕囊。如果昨天就已经吃了流产药，到现在孕囊还没有排出来，应该复查B超，仍然证实宫腔内有孕囊存在，那就可以直接清宫来结束妊娠。