一般情况下，月经12天了还没干净可能会不孕，也可能不会，需根据患者的实际情况来判断。
月经12天了还没干净可能是月经淋漓不断的病情，如果患者在月经期间不注意保暖，会导致宫寒，从而可能会发生这种情况，患者可以在医生的指导下使用益母草颗粒进行治疗，一般可能不会导致不孕；如果月经12天了还没干净是因为妇科疾病引起的，如输卵管炎、子宫内膜炎等，建议患者及时去医院就诊，查明病因后对症治疗，这种情况下可能会影响受精卵的输送或着床，从而可能会导致不孕。
月经12天了还没干净会导致不孕，月经12天了还没干净属于月经期过长，月经少。月经是子宫内膜脱落出血引起，受到卵巢分泌激素调节。引起月经长时间不干净的原因最常见的是功能性子宫出血，这个是卵巢分泌激素失调，导致子宫内膜脱落不干净。
一般情况下，如果想怀孕，不但需要女方的输卵管是通畅的，还需要子宫内膜适合着床，男方的精子质量是正常的这几个怀孕所必需具备的基本条件，所以如果单凭月经准时不能判断能不能怀孕。
怀孕是个非常复杂的过程，首先需要排卵正常，也就是月经正常，还需要输卵管通畅，需要子宫内膜的容受性正常，所以说如果月经准时，也会不孕的。
一般情况下，月经正常不怀孕就提示患者不孕不育的因素可能与输卵管的病变有一定的关系。女性怀孕需要三个比较基本的条件，排卵正常、输卵管正常、子宫发育正常。患者的月经正常一般就代表着患者的卵巢功能是正常的，卵泡发育是正常的，子宫的发育也是比较正常的。但是输卵管是否通畅，需要检查输卵管造影来确诊，不然不能明确判断。
一般来说，月经量少是否会导致不孕，需要根据引起月经量少的原因进行判断。
1.会导致不孕：如果是子宫内膜粘连而引起的月经量少，可能会导致不孕。而且如果是多囊卵巢综合征导致没有排卵，而引起的无排卵型功血，一般也会导致不孕。
2.不会导致不孕：如果女性是人流手术导致子宫内膜损伤，而引起子宫内膜偏薄，但是在术后有正常排卵，一般这时还是能够怀孕。只是在怀孕以后，可能会出现习惯性的流产表现。