先天性甲状腺功能减退主要是由于患儿甲状腺先天性缺陷，或母体孕期饮食中碘缺乏所致。
这种病是小儿常见的内分泌疾病，主要临床表现为体格和智力发育障碍。先天性甲低的主要原因是甲状腺不发达或发育不全，也有甲状腺激素合成途径中的酶缺陷，由促甲状腺激素缺陷和甲状腺、靶器官反应减退者引起的比较少见。实验室检查主要表现为T3、T4水平下降，TSH水平上升，治疗主要以左甲状腺激素片替代治疗，早期开始治疗，预后较好。
新生儿先天性甲状腺功能低下的症状有：智力低下、表情迟钝、异常安静、不活泼、矮小、面部及手肿胀、聋哑、呼吸困难、黄疸、哭泣低、头发稀少干枯、四肢不温、脐疝、腹胀便秘、骨骼发育迟缓、胫骨上端及胸骨下端没有骺骨等。
是由于先天性甲状腺发育不良或甲状腺激素合成过程中酶的缺陷所造成的。表现如便秘、黄疸消退延迟、少动、少哭、生长发育迟缓，皮肤比较粗糙、干燥，智力低下表现，与之互动时无眼神交流，无主动沟通意识。
新生儿甲状腺功能低下会导致非常严重的问题，因此在新生儿出生后要做好甲状腺功能筛查，然后再进行临床观察。如果儿童出现甲状腺机能减退，需要立即采取措施。新生儿甲状腺机能减退主要有以下几种症状：
1.初期：儿童出现不典型的症状，如拒食、活动少、黄疸消退延迟、体温异常、皮肤粗糙等。
2.后期：儿童会有特殊的症状，如大舌头，特殊的面容，智力低下等。
由于先天性甲状腺功能对儿童生长发育、智力形成、大脑细胞的分化有很大的影响，因此，新生儿的先天甲状腺机能低下会严重地影响到婴儿的生长发育和智力的正常发展。
因此，如果一个婴儿的甲状腺机能下降，孩子的智商会下降，身高也会变得比常人要慢，不能够及时的察觉到这种情况，就会导致孩子的智商下降，或者是大脑迟钝。
幼儿甲状腺功能低下原因如下：
1.甲状腺先天性发育不良甚至缺失：属于幼儿胚胎等时期的不良因素，会引起甲状腺发育不良，导致甲状腺激素产生减少。
2.甲状腺激素生成障碍、转运障碍、甲状腺作用组织相关受体功能缺陷：这表现为甲状腺激素生成、转运、起效三个环节出现异常，血液中甲状腺激素水平下降。
3.暂时性甲状腺功能减退：幼儿因早产、低体重、幼儿母亲孕期服用抗甲状腺药物等因素，其童甲状腺功能受到抑制。
4.地方性碘缺乏：这种情况起因于地理环境，是该地区土壤和用水中碘含量过少造成的，俗称大颈病。
5.自身免疫性疾病：自身体内产生甲状腺抗体，破坏甲状腺组织，导致甲状腺功能下降。