甲状腺囊性结节能否自愈，需要根据情况而定。
小的甲状腺囊性结节可以自己治愈，但大的不行。甲状腺结节部分为囊肿，部分为腺瘤囊性病变。甲状腺囊性结节有良性和恶性之分，极小的良性囊性结节部分直径小于0.5CM可自行消失，恶性和大良性囊性结节需治疗手术。小囊甲状腺结节随访观察时间可能较长，其间定期复查，观察其变化。观察中长大，仍需及时改变方案，接受手术治疗。
很小的甲状腺囊性结节可以自愈，大得不行。甲状腺囊性结节有一部分是囊肿，有一部分是腺瘤囊性变。甲状腺囊性结节有良性与恶性之分，极小的良性的囊性结节，直径小于0.5CM的有一部分可以自行消失，恶性的和较大的良性囊肿结节需要手术治疗。
如果是急性化脓性甲状腺炎，一般都是不会自行愈合的，一般都是通过抗生素来进行治疗的。
另外，如果单纯应用抗生素无法抑制炎症和脓肿的发展，就必须进行外科切开引流。在做手术的过程中需要考虑到相应的危险。除了有麻醉的危险，还有就是手术会导致甲状腺机能下降，嗓子沙沙等。因此，如果要做手术，做切口引流术，要与病人和病人的家人进行充分的交流，避免出现相关的危险。
一般来讲甲状腺结节是不会自愈的，具体原因分析如下：
甲状腺结节多是在甲状腺肿的基础上，出现结节，可以是由于食物中碘缺乏，或者是正值青春发育期，妊娠期，哺乳期，对甲状腺素需要量增加，出现甲状腺肿大，需要手术治疗才能治愈。如果合并有神经压迫症状，造成声音嘶哑，饮水呛咳，必须接受手术治疗。平时少吃辛辣刺激的食物，忌烟酒，保持充足的睡眠，少熬夜。
甲状腺结节可能会自愈，也可能无法自愈。
假如是炎症导致甲状腺结节，如亚急性甲状腺炎引起甲状腺肿大，此症亦能自愈，可治愈。其如肿瘤性结节，包括良性结节、恶性的等都不能自行好转。所以要想把它完全治愈，那一定得有一个过程，这个过程就是所说的自愈。若不用办理，对其进行经常性的观察即可，如有必要对待，需采取某些手术等其它方法，使其排除，自愈也不行。