甲状腺激素降低应根据不同情况选择不同方法治疗。
如果甲状腺激素低但甲状腺激素分泌正常，就要考虑患者是否有严重的全身疾病。如有严重全身疾病，应注意原发性甲状腺疾病的治疗。如果只是单纯游离甲状腺激素低、促甲状腺激素高，就有可能是甲状腺功能下降所致。那样的话，需要综合患者的具体情况进行检查，在医生的指导下用药。甲状腺激素降低主要与原发性甲状腺功能减退、继发性甲状腺功能减退及下丘脑性甲状腺功能减退有关。总之，甲状腺激素偏低一定要去医院检查甲状腺激素指标，根据病情制定合理的治疗方案。
孕妇游离甲状腺激素降低，应结合促甲状腺激素共同判断。
孕妇怀孕期间游离甲状腺激素水平波动，孕妇游离甲状腺激素水平可能早期升高。一些怀孕孕妇在早孕阶段表现出高于正常值的水平，但随着孕周的发展，游离甲状腺激素水平逐渐下降。特别是在妊娠末期，也可能有游离甲状腺激素低于正常范围下限的孕妇。此时建议与促甲状腺激素一起观察。如果患者的促甲状腺激素水平正常，低于2.5μU/L通常并不需要使用左甲状腺素钠进行替代治疗。如果促甲状腺激素水平高于4.0μU/L，通常需要进行左甲状腺素钠的替代治疗，以帮助纠正游离甲状腺激素，以及让促甲状腺激素水平回落。
以下是游离三碘甲状腺素偏低的解决办法:
1.可以考虑稍微减少一点抗甲亢药物（例如他巴唑等）的摄入，同时监测、定期复查甲功，尽最大可能将药物调整到一个比较好的剂量，使甲状腺素维持在正常范围内。以免从甲亢治疗成甲减。平时不要吃辛辣刺激性食物，不要吃腥臭的食物。
2.甲状腺素低的患者应该多吃一些比较有营养的水果，食物，别吃那些辛辣带有刺激性的食物。治疗可以使用国内先进科技治疗或者中医疗法治疗，应该到医院进行相关检查，再根据自身病情来进行选择哪种方式进行治疗，这样具体治疗方法才比较有效。
游离甲状腺素偏低需要采取补充药物治疗，由于甲状腺细胞不能够恢复正常，所以终身替代食用甲状腺素治疗，定期复查甲状腺功能，如果有异常特别是偏低，说明用甲状腺素不足，需要加大剂量。
孕妇游离甲状腺激素降低，应结合促甲状腺激素共同判断。
孕妇怀孕期间游离甲状腺激素水平波动，孕妇游离甲状腺激素水平可能早期升高。一些怀孕孕妇在早孕阶段表现出高于正常值的水平，但随着孕周的发展，游离甲状腺激素水平逐渐下降。特别是在妊娠末期，也可能有游离甲状腺激素低于正常范围下限的孕妇。此时建议与促甲状腺激素一起观察。如果患者促甲状腺激素水平正常，低于2.5U/L，一般不需要使用左甲状腺激素钠替代治疗。甲状腺激素水平高于4.0U/L时，为了纠正游离甲状腺激素，降低促甲状腺激素水平，一般需替代治疗左甲状腺激素钠。
甲状腺引起甲减，游离甲状腺激素偏低，需补充甲状腺激素。垂体瘤、炎症、损伤引起的游离甲状腺激素减少需要原发疾病的治疗，同时补充剩余垂体激素同时补充左甲状腺激素纠正游离甲状腺激素下降。
此外，某些严重疾病等生理因素会使身体出现代偿性，低T3综合征游离甲状腺激素水平也会下降不需要治疗。治疗原发疾病，原发疾病恢复后，低游离甲状腺激素恢复正常。一些女性在妊娠晚期游离甲状腺激素下降。医生检查碘的摄入是否不足和是否缺铁。此外孕晚期甲状腺激素的检查单多在正常范围内，孕期并不是特异性结果，可能比非孕期表现低值，但实际上是生理变化，不需要特殊治疗。