手腕腱鞘囊肿可以使用药物或者是手术进行治疗。
对患者发生手腕部位腱鞘囊肿时，多表现为腕关节内压力升高，由此可使腕关节内滑液外渗增加，可在腕背部关节囊相对薄弱处形成腱鞘囊肿。在腱鞘囊肿形成后，没有引起腕部显著疼痛的话，并不会影响手腕的屈伸活动，此种情况可以不作特殊处理。也可以进行囊肿穿刺以引流其内滑液，再注入糖皮质激素类药物至囊壁粘连，以消除腱鞘囊肿。若腱鞘囊肿较大，引起腕关节部位酸痛，并影响腕部屈伸活动时，此病例宜手术摘除。
一般情况下，腱鞘囊肿是手腕上一种较为普遍的病症，属于一种囊状的结节，其内部含有凝胶状的粘稠物质。左手腕腱鞘囊肿会导致手腕软弱感和疼痛，这种肿块是一种良性的，如果不小心碰到坚硬的物体，很容易就会消失。较大的可能会被挤压，或是在吸入后用荷尔蒙进行处理。如果体积变大了，会对日常的生活造成一定的影响，可以考虑进行囊肿切除术。对于左手腕腱鞘囊肿来说，不管是保守疗法，还是外科疗法，都有可能出现反复发作的情况。
腕腱鞘囊肿的治疗主要有药物和外科两种。因为大多数的腕部囊肿都是从手腕的深层而不是肌腱。手腕腱鞘囊肿是一种常见的疾病，当囊肿逐渐变大，表现出腕关节活动障碍时需要进行治疗，可以采用针头抽吸、加压包扎等保守疗法，治愈率大约在百分之50左右。也可以采用传统的外科治疗方式，从根部取出囊肿，或者采用微创的方式，可以获得很好的治疗效果，并且很少有复发。
一般情况下，手腕腱鞘囊肿患者可以通过以下方法进行治疗。
1、休息制动：对于较小的腱鞘囊肿，且手腕没有出现疼痛、活动受限等症状时，可以通过休息制动，同时配合理疗，一般囊肿就会逐渐变小，甚至消失。
2、药物治疗：当患者的腱鞘囊肿较大，且压迫到手腕部出现了疼痛和活动受限等症状时，可以服用非甾体类抗炎药如塞来昔布、洛索洛芬钠等消炎止痛。同时还可使用注射器抽取囊内内容物，并向其内注射糖皮质激素以缓解症状。
腕部的腱鞘囊肿最常见的是桡侧腱鞘囊肿，可能是因为最近有腕部的扭伤，也可能是外伤史，最近的腕部反复屈伸，剧烈的运动导致了肌腱的炎症和局部的囊肿。在囊肿形成初期，可以进行局部的推拿理疗，也可以进行自我吸收，也可以进行破裂，也可以通过外科手术将囊壁和囊肿一并切除，这样才能完全治愈，但也要注意避免长时间的重复运动导致的复发。
手腕部位腱鞘囊肿经挤压可破裂并能减轻。
腱鞘囊肿有许多是由关节产生的，可采用按摩、揉捏、试着能否使其进入关节腔的方法。还可设法将腱鞘囊肿顶入骨内，强行挤压可将囊肿击碎。但由于囊壁尚存在，此种治疗复发机会较多。建议到医院做手术彻底切除，效果会更好。
建议患者在日常不要自行挤破腱鞘囊肿，避免引发不适症状。