肺脓肿要根据引起肺脓肿的病原体的类型来选择抗菌药物。
大多数对于肺脓肿感染的细菌，以及有些厌氧菌，都可以选择使用青霉素。如果青霉素过敏，可以选择克林霉素，还可以联合使用甲硝唑治疗。
由军团杆菌所引起的肺脓肿，可以首选大环内酯类药物，比如红霉素、阿奇霉素、克拉霉素等药物。
由革兰氏阴性杆菌引起的肺脓肿，可以选择氨基糖苷类的药物，比如妥布霉素，以及联合喹诺酮类的药物，比如左氧氟沙星、加替沙星等。
肺脓疡不宜进行运动。肺脓肿的主要症状是高热、咳嗽、咳脓痰，平时要多休息，保持体力，不能运动，如果是轻度的，可以多走走，肺脓肿要多喝水，进行消炎化痰。最好在有必要的时候做脓腔引流。可以进行轻微的步行，即饭后出去走走，避免给腹部造成压力，造成对膈肌的压迫。当胸腔内的压力升高，再加上腹腔内的压力升高，这种情况就会变得更加的明显。建议在日常生活中多进行深呼吸运动，增强肺部功能。
肺脓肿穿刺主要是为了引流脓液，同时还可以对脓肿内部进行药物治疗，加快病灶的吸收。肺脓肿大多数是由于肺部的化脓性炎症所引起的肺部组织坏死，主要通过胸部CT检查来查看病变，肺脓肿的内科治疗方法主要是以抗生素为主，还要加强脓肿的引流，来提高治疗的疗效，而脓液引流，主要是化痰，促进脓液排出，如果以上的措施效果并不好，通过肺脓肿穿刺引流方法是比较好的，而且能够快速控制病情，创伤也比较小。
中医不能治疗肺脓肿。肺脓肿是由肺部组织坏死所形成的脓腔，需要根据患者的病情来配合使用不同的药方，当患者感染上肺脓肿以后，常常会有咳嗽、咳痰等症状出现，部分病情较严重的患者甚至会感到呼吸不畅。需要治疗肺部脓肿的药物，使用敏感的抗生素，一般需要6-8个星期。一些中药具有抑制细菌的作用，可辅助治疗，但是不能用中医的中药来代替抗生素。
肺脓肿需要挂呼吸内科，症状比较严重的时候需要挂胸外科。肺脓肿属于肺组织遭受到了原细菌侵犯而造成的肺组织发生坏死或者发炎，最终会让肺部积聚大量的脓性积液，患者主要会表现为咳大量脓臭、咳嗽以及高热的症状，同时还有可能会伴有食欲不振、盗汗以及咳血。如果患者的痰液得不到有效控制的时候，则需要通过手术的方式将病变的肺部切除。