如果出现咳嗽扁桃体发炎，建议去医院呼吸科检查。如果是上呼吸道感染，或是其他感染性疾病的早期症状，建议及时去医院做进一步的检查。需要进行血常规、血沉、支原体抗体、胸部CT等检查。才能判断出具体的病因，并进行相应的治疗。如果是血液常规检查显示白细胞升高，检查时会发现扁桃体肿大、化脓。如果胸部CT检查没有发现异常，那么应该考虑是上呼吸道感染所致的急性扁桃体炎。
小孩扁桃体炎咳嗽是由于扁桃体中的某些炎症渗出过多而引起的，此外，扁桃体炎、肺炎、支气管炎、肺炎等并发症时，咳嗽的可能性更大，要结合自身的情况，制定相应的治疗方案。急性扁桃体炎是由细菌感染引起的，常见的有链球菌、葡萄球菌、流感嗜血杆菌等，可以选择一些敏感的抗生素进行抗感染治疗，比如大环内酯类的抗生素、青霉素类的抗生素、头孢类的抗生素。
扁桃体发炎，引起咳嗽严重的需要输液消炎治疗，同时配合雾化吸入抗炎止咳，稀释痰液利于咳出。同时可以给孩子做雾化，雾化的话，止咳效果的效果比较好，但具体的用药还需要遵循医嘱。
扁桃体发炎，咳嗽有黄痰，很有可能是急性扁桃体炎并发急性的支气管炎，造成咳黄色的脓痰。治疗上主要是应用足量敏感类的抗生素，头孢菌素类的抗生素，可以根据病情的轻重程度决定给药的途径，如口服或者静脉注射。
一般孕期扁桃体发炎咳嗽有以下方法可以止咳：
患者可以通过服用麦冬、胖大海、来进行治疗，也可以同时配合利咽灵、保安散、草珊瑚含片等药物来进行治疗。如果病情严重的话，患者可以使用抗生素和反流感药物来治疗，但如果病情越来越严重，建议患者前往医院进行治疗。
同时建议患者在治疗期间不要吃辛辣刺激性食物，饮食应以清淡为主。
感冒后咳嗽久治不好扁桃体发炎建议遵医嘱使用抗生素类药物口服还可以切除。感冒容易导致扁桃体发炎，尤其是慢性扁桃体炎。扁桃体发炎可以服用阿莫西林、口服慢严舒柠颗粒等抗菌药物，一般情况下都会有很好的疗效，可以通过服用板蓝根水进行预防。扁桃体切除手术是治疗扁桃体反复发炎的最佳方法。扁桃体发炎一般都是由链球菌感染引起的，一般会选择抗生素进行抗感染治疗，青霉素是首选的药物，如果出现青霉素过敏，可以使用红霉素等。