三个月宝宝吃益生菌可以在三个月宝宝配方奶粉中添加一些益生菌，让其充分溶解后再喂食。父母还可以将其放入温水中，水温不宜高于40℃，因为这是一种活性微生物，一旦遇到温度升高，就会失效。给三个月宝宝喂食后20-30分钟能有效发挥药效，可以起到一定的作用，可以帮助宝宝增强消化能力，减轻身体的不适。父母给宝宝喂奶粉的时候注意少量多次。
益生菌具有一定的调节肠道的作用，对宝宝的生长发育是有一定的好处的，宝乐安的益生菌，三个月大的宝宝一次吃半包，一天吃三次，温水化开，在吃奶以后，半个小时左右的时间服用，效果是比较好的。
新生儿益生菌可以在饭后吃。
益生菌能够改善新生儿的便秘、消化不好等，但是益生菌的种类不同，益生菌一般包装上都有具体的说明，益生菌尽量饭后吃，吃的时候水温不能过高，一般冲益生菌的水温40℃以下，水温过高益生菌的效果就不好了。如果宝宝的便秘症状减轻或者腹泻症状减轻，可以停止药物的应用，等到有症状以后还可以进行补充，益生菌能改善消化不好的情况，促进胃肠功能的吸收和消化功能。
科汉森益生菌餐前半小时服用，这种益生菌是质量还是比较不错的，刚出生的小宝就能吃的，水温要控制在37度以下的，这个除了用来调理肠胃以外，也可以增强自身的免疫力，效果还是很不错的。
新生儿益生菌的吃法主要是可以用温水冲泡益生菌后让宝宝服用，但是益生菌不能长时间吃，长期使用益生菌，在停药后缺乏外界药物的补充有可能会导致肠道菌群失调，容易影响正常的肠胃功能。
一般现在的话一天3次，一次半包或是一包都行，这个因为是补充肠道的有益菌，多点是没有问题的、但宝宝的年龄这类药物是可以口服的，同时注意宝宝腹部的保暖及饮食或哺乳的清洁，如果是母乳哺育建议母亲忌下辛辣刺激性食物，并可以按摩宝宝腹部提高宝宝肠消化吸收功能。