新生儿有痰用温热的毛巾轻轻捂住其鼻部或用热气熏蒸，也可帮助宝宝将喉咙里的痰液变稀，利于痰液的顺利咳出，还可缓解其喉咙红肿和发痒症状。但在使用热毛巾和熏蒸时，温度不可过高，以免烫伤宝宝口鼻部位。治疗方法是药物治疗和物理治疗。
新生儿有痰，首先可以给宝宝多喝温开水，勤拍后背能起到排痰作用，可以使用空心手掌由上而下轻轻的扣拍宝宝的后背，每次最好保持5分钟，每天坚持拍打三次到4次左右，如果宝宝出现呛奶和土墨的情况，大多数属于新生儿肺炎，需要及时到医院就诊，让医生根据具体症状和检查结果来做出针对性的治疗，以免会影响到宝宝的身体健康，平时要以少食多次的方法喂奶。
如果是刚出生的婴儿，在婴儿咳嗽的时候，不管是肺部有什么问题，还是拍的片子都是支气管和肺炎，都应该住院。如果婴儿的症状不是特别严重，经过治疗，已经可以出院了。但是如果只是有痰，可以服用一些止咳化痰的药物，也可以用消炎的药物来进行治疗。同时还要注意观察婴儿的进食情况，如果没有问题，那么在接下来的治疗中，痰液会慢慢的被吸收。
干咳有痰考虑上呼吸道感染引起来的咽喉部的炎症。会有咽喉部的一些充血和水肿，需要使用针对上呼吸道感染的药物来进行治疗，对于上呼吸道的初期感染一般选用中成类的抗病毒药物。
一般情况下，新生儿喉咙有痰，因为新生儿多个脏腑尚未发育，有咳嗽反应能力差的情况，可采取以下措施：
1、多喝水：能帮助清痰，最简便，易于掌握；
2、喷雾式吸气：先使用沐舒坦化痰，然后进行喷雾，当唾沫被冲淡后，更容易将唾沫喷出，同时可以让孩子在肩膀下的角度上做一个旋转动作；
3、口服化痰剂：糖浆化痰剂等，要在医师的建议下服用。
具体的使用方法要根据临床情况，在医师的建议下进行。
一般情况下，12天新生儿有痰可以通过以下方式进行治疗。12天龄的婴儿咽腔狭窄，喉咙、咽腔有分泌物时会有粘液，平时多给孩子喝水、拍背。新生儿咽喉部的软骨发育不全会出现痰液，如果新生儿饮食、精神、睡眠正常，则会随着生长发育的改善而消失。咽喉有痰，会对孩子的进食造成一定的干扰，会导致呼吸增快、面色发紫等。