扁平疣掉了留褐色印子可通过药物等方法进行治疗。如果想让棕色印早日消失，可以用维生素E或肝素钠凝胶擦拭患处，平时不要吃辛辣食物或不要吃酱油以及醋等深色素食物。如果想好的快点局部可以擦肝素钠凝胶或者维生素E促进局部血液循环，有利于恢复。
在生活当中也应当注意，不要过度的情绪激动，不要吃热性的食物，多吃蔬菜水果。
可以外涂药膏，多吃蔬菜水果。使用能修复皮损，有效提高细胞活性，促进细胞再生，从而修复缺损的真皮层的药物。假如不是瘢痕体质，通常是可以淡化的，平时适当多喝水，促进皮肤的新陈代谢。
可以进行物理治疗，包括冷冻疗法，还有激光治疗。也可以外用相关药物进行涂擦的，另外也是可以选择口服药物治疗。同时在这期间需要注意饮食要以清淡为主，最近不要吃辛辣的食物。
扁平疣可以通过口服药物进行调理。因为从口腔到五脏六腑的消化过程中，会有大量的药物流失，无法杀死病菌，因此，这种药物的作用并不是很好，而且需要数十日的时间，普通人根本无法承受。扁平疣可以通过激光切割。因为扁平疣是在皮肤表层，因此，雷射只能清除表层的扁平疣，而不是清除皮下的病毒，因此无法从根本上治愈，通常数个月后，它又会再次出现。
一般情况下，下眼皮长扁平疣可以通过药物治疗、生活护理等方式进行改善，具体内容如下：
下眼皮长扁疣，如果影响美观，并且出现瘙痒等情况，建议到医院皮肤科进行治疗，通过激光或冷冻等方式进行治疗。术后要注意日常的局部消毒，防止感染。平时要多吃一些清淡、容易消化、维生素含量高的食物，多吃一些新鲜的水果和蔬菜。不要吃辛辣刺激性的食物，也不要吃鱼、虾、海鲜、螃蟹等容易引起过敏的食物。