如果有扁平疣，可通过以下药物治疗：
1.可以服用重组人干扰素α-2b凝胶、咪喹莫特软膏等调整免疫力的药物；
2.还可以选择维A酸乳膏、他扎罗丁凝胶、阿达帕林凝胶等维甲酸类的药物。外用药渗透性、吸收性都比较差，而且皮损比较多；
3.可以通过激光、电灼等物理疗法来进行；
4.免疫功能低下的人容易得扁平疣，所以可以服用一些可以提高免疫力的药物，例如转移因子胶囊。
眼睛上长扁平疣是由病毒感染引起的，具有传染性，可通过如下方法改善去除：
1.眼皮上肉皮比较薄不建议做激光或者冷冻，可以用药物治疗。
2.可以外用他扎罗丁凝胶或阿达帕林凝胶在伤口上涂抹，或用0.5%的鬼臼毒素酊点涂于扁平疣的地方，而非正常皮肤。
3.可以服用病毒灵、异维A酸胶囊、牛羊肉、鱼虾等食物。
4..在日常生活中尽量不要搔抓，个人卫生用品要和别人分开使用，以防发生感染。
脸部扁平疣用水杨酸软膏、维A酸软膏、咪喹莫特软膏、氟尿嘧啶软膏等可以去除。
扁平疣是由人乳头瘤病毒感染皮肤黏膜所引起的良性赘生物，多发生在面部、手背及前臂等，主要表现为扁平小丘疹，一般没有自觉症状。如果患者出现瘙痒症状，可以遵医嘱使用水杨酸软膏、维A酸软膏、咪喹莫特软膏、氟尿嘧啶软膏等药物治疗。
扁平疣可以外用重组人干扰素涂抹治疗试试的，它的病原体和寻常疣一样，是由乳头状瘤病毒HPV3和HPV5感染引起的皮肤赘生物，急性期扁平疣可用抗病毒的药物治疗。平时忌烟酒，辛辣刺激性饮食，多吃蔬菜、水果补充多种维生素，注意个人卫生，忌与他人共用清洁用具。
扁平疣用咪喹莫特软膏、氟尿嘧啶软膏等药膏去除，用药应谨遵医嘱。
扁平疣是由人乳头瘤病毒（HPV）感染皮肤黏膜所引起的良性赘生物，是疣的一种，多发生在面部、手背及前臂等部位，其损害往往是数目较多的扁平小丘疹。患者可以在医生的指导下使用咪喹莫特软膏、氟尿嘧啶软膏等药膏进行治疗，这些药物均为皮肤用药，能有效去除扁平疣。
一般情况下，下眼皮长扁平疣可以通过药物治疗、生活护理等方式进行改善，具体内容如下：
下眼皮长扁疣，如果影响美观，并且出现瘙痒等情况，建议到医院皮肤科进行治疗，通过激光或冷冻等方式进行治疗。术后要注意日常的局部消毒，防止感染。平时要多吃一些清淡、容易消化、维生素含量高的食物，多吃一些新鲜的水果和蔬菜。不要吃辛辣刺激性的食物，也不要吃鱼、虾、海鲜、螃蟹等容易引起过敏的食物。