一般来说，婴儿生殖器畸形可通过以下方式进行处理，具体分析如下：
手术是治疗婴儿生殖器畸形的常见手段，但是不同程度的病情，手术方案不同。做尿道口成形术可以对症治疗轻微的尿道下裂；做阴茎矫正手术加尿道重建手术能有效改善较为复杂的尿道下裂；肾盂成型手术、输尿管扩张手术以及膀胱壁瓣输尿管成型术等能治疗输尿管狭窄等畸形问题。
在日常生活中，家长可以让患儿呼吸新鲜空气，多晒太阳，居室保持空气流通、新鲜。此外，患儿的饮食宜清淡、易消化，忌食辛辣、生冷的食物。
孩子的生殖器仍未发育完全，因此目前的症状无法诊断。阶段的孩子长得很快，需要更多的营养。平时，需要注意营养的补充和微量元素缺乏的可能性。如果缺乏，也会影响孩子的成长和发展。
婴儿出现斜颈时，要明确是否为先天性肌性斜颈，同时需要排除外伤性、炎症性、眼源性、耳源性、骨性及习惯性斜颈。先天性肌性斜颈处理原则：及早诊断，尽早治疗，效果好。手法按摩治疗斜颈适用1岁以内者，如能及早坚持手法治疗，多数可获得矫正。
婴儿咳嗽以先使用化痰止咳的药物，适当的多喝水，保持室内的湿度高一些，也可以给孩子雾化吸入缓解咳嗽症状。给予处理以后咳嗽没有明显的缓解甚至说有加重的趋势，孩子的吃奶减少，精神状态差，需要考虑肺炎的可能，应该到医院进行进一步的检查。
宝宝厌奶一定要从多方面来注意观察，如果宝宝舌苔厚，大便有奶瓣儿，可能是消化不良的表现，如果有感冒发烧等症状，也可能是感冒引起的多给宝宝按摩腹部，采取少量多次喂奶，同时一定要保持大便通畅。
如果孩子咳嗽症状较轻，无其他不适症状，可以给孩子先多喝水观察，并保持室内温湿度适宜，以免因室内过于干燥导致孩子咽喉部刺激引起干咳，如果孩子出现干咳并伴有打喷嚏、流鼻涕等症状，可能是上呼吸道感染，可以给孩子口服药物观察，如果孩子干咳时间较长，口服治疗咳嗽药物无效，可能与过敏原因有关，需要到医院查过敏原。若是母乳喂养的孩子，孩子妈妈也不可以吃可能导致过敏的食物，以免孩子咳嗽加重。